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vigaryang木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【討論】NBO分析中如何判斷π相互作用? 已有7人參與
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當(dāng)對分子A和分子B的復(fù)合物進(jìn)行NBO分析時，得到如下的一組軌道相互作用： Donor Acceptor E(2) 161. LP (2) O 35 /991. BD*( 2) N 1 - C 5 0.09 由化學(xué)結(jié)構(gòu)式知道N1和C5之間是雙鍵，那么能不能根據(jù)上面顯示的結(jié)果認(rèn)為A與B之間發(fā)生了p-pai相互作用？謝謝。 |
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heyo_123(金幣+2):鼓勵交流��！ 2010-07-06 16:31:09
aylayl08(金幣+2):謝謝交流 2010-07-07 10:54:19
vigaryang(金幣+1):3 2010-07-11 16:36:10
vigaryang(金幣+2): 2010-07-11 16:36:22
heyo_123(金幣+2):鼓勵交流��！ 2010-07-06 16:31:09
aylayl08(金幣+2):謝謝交流 2010-07-07 10:54:19
vigaryang(金幣+1):3 2010-07-11 16:36:10
vigaryang(金幣+2): 2010-07-11 16:36:22
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首先ＮＨＯ和ＮＢＯ軌道是由不同的方式得到的軌道，一個是自然雜化軌道，一個是自然鍵軌道。 如果不加特別的關(guān)鍵詞我們得到的是ＮＢＯ軌道的信息。 以ＮＢＯ軌道為例，如果想知道兩個原子間成的是單間還是雙鍵，通過查看ＮＢＯ分析結(jié)果中Ｃ和Ｎ之間形成了幾個ＢＤ就可以大概得到，但比較可靠的還是要分析由Ｃ１－Ｎ５組成的ＢＤ的組分，如ＢＤ（１）Ｃ１－Ｎ５是由Ｃ１的２ｓ和Ｎ５的２ｓ組成的ｓｉｇｍａ軌道，也可以看出ｓ軌道的％比，當(dāng)然一般會有部分２ｐ的參與，假定為２ｐｘ的參與，我們可以得出，ＢＤ（１）Ｃ１－Ｎ５為在ｐｘ方向上形成的一個ｓｉｇａｍａ鍵；同樣我們可以分析ＢＤ（２）Ｃ１－Ｎ５假定為在２ｐｙ方向上形成的ｐｉ鍵，也可以得到C1和N5分別的貢獻(xiàn)假定前者為67%，后者為33%。 而反鍵ＢＤ＊（２）Ｃ１－Ｎ５則是C1的貢獻(xiàn)為33%，N5的貢獻(xiàn)為67% 當(dāng)分析片段間或是分子間的相互作用時，一般NBO會給出一些unit，分析unit之間的相互作用 如一樓想知道A和B之間是否有pi相互作用，那就需要去分析unit之間E(2)值比較大(一般要大于5 kcal/mol)的幾個Donor Acceptor 相互作用，看是否有pi鍵的參與，有時候一個pi鍵參與了幾個相互作用，是可以疊加起來來考慮的。 |
5樓2010-07-06 15:40:12
qzhaosdu
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2樓2010-07-03 14:20:12
vigaryang
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4樓2010-07-03 17:18:37
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