 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3312 | 回復(fù): 10 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】關(guān)于dmol中部分原子固定的幾何優(yōu)化問(wèn)題 已有4人參與
|
|||
|
大家好，想向大家請(qǐng)教一個(gè)問(wèn)題： 我在用DMOL對(duì)slab模型的結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化的時(shí)候 固定了底層原子 一共是三層，固定的時(shí)候用的是固定分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，且沒(méi)有固定晶格參數(shù)，在進(jìn)行優(yōu)化設(shè)置的時(shí)候也沒(méi)有 optimize cell奇怪的是,當(dāng)幾何優(yōu)化結(jié)束的時(shí)候 我把固定原子的笛卡爾坐標(biāo)進(jìn)行比較的時(shí)候發(fā)現(xiàn)還是有細(xì)微的差別，我不知道這是為什么， 這樣的話，我后面在進(jìn)行過(guò)渡態(tài)搜索的時(shí)候就會(huì)出現(xiàn)問(wèn)題，我的生成物都是從反應(yīng)物的構(gòu)型復(fù)制過(guò)來(lái)的基礎(chǔ)上改動(dòng)再進(jìn)行優(yōu)化的，按理說(shuō)固定原子的坐標(biāo)應(yīng)該不會(huì)改變，但優(yōu)化過(guò)程居然也能改變固定原子的位置！這就導(dǎo)致我在原子配對(duì)的時(shí)候出現(xiàn)Fixed atom coordinate mismatch Fixed atom coordinates should match to within 0.00010 的問(wèn)題，我不知道該如何解決了 請(qǐng)大家?guī)蛶臀?謝謝！ |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
環(huán)境領(lǐng)域全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料專碩306英一數(shù)二
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
301求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
26博士申請(qǐng)
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
268求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
311求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
被我言中：新模板不強(qiáng)調(diào)格式了，假專家開始管格式了
已經(jīng)有4人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- DMol3優(yōu)化晶胞的問(wèn)題
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 我用Dmol3進(jìn)行幾何優(yōu)化時(shí)，MS計(jì)算energy到第50步時(shí)，就失敗了！
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 請(qǐng)問(wèn)固定原子坐標(biāo)是不是在CASTEP中不起作用啊？在Dmol3中起不起作用呢？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】dmol添加原子時(shí)底層跑到真空層最上方
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】C60富勒烯籠里面放了一個(gè)Fe原子，用Dmol3結(jié)構(gòu)優(yōu)化不收斂
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助成功】dmol3算C60吸附Al原子的怪異結(jié)果
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【求助】Gulp中的幾何優(yōu)化，MD等和Dmol3的中的有什么區(qū)別？
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 【求助】dmol可以把原子設(shè)為負(fù)價(jià)或者正價(jià)么
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【求助】關(guān)于晶胞中取代一個(gè)原子的優(yōu)化問(wèn)題
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 【求助】50金幣求助，金屬間界面和金屬氧化物間界面模型怎么建立？
已經(jīng)有30人回復(fù)
akashia
銀蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 318.5
- 散金: 37
- 帖子: 57
- 在線: 8.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 733830
- 注冊(cè): 2009-03-28
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
★
gavinliu7390(金幣+1):謝謝交流！ 2010-07-07 15:06:23
水月慧心(金幣+2): 2010-07-07 17:35:10
gavinliu7390(金幣+1):謝謝交流！ 2010-07-07 15:06:23
水月慧心(金幣+2): 2010-07-07 17:35:10
|
dmol3不支持分?jǐn)?shù)坐標(biāo)的固定。 DMol3: Supports atom positions fixed in Cartesian space, and partial constraints on the x, y, or z components of Cartesian atom positions, but ignores constraints on fractional positions and lattice parameters. Additionally, DMol3 supports fixed interatomic distances, angles, and torsions in nonperiodic structures. |
5樓2010-07-07 14:54:22
cmwangdft
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 1870.5
- 散金: 65
- 紅花: 2
- 帖子: 111
- 在線: 224小時(shí)
- 蟲號(hào): 487968
- 注冊(cè): 2007-12-29
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
2樓2010-07-07 08:56:37
3樓2010-07-07 12:26:34
6樓2010-07-07 17:41:06
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +7 | zjl的號(hào) 2026-03-16 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[碩博家園] 湖北工業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)與健康學(xué)院-課題組招收2026級(jí)食品/生物方向碩士 +3 | 1喜春8 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料專碩326求調(diào)劑 +6 | 墨煜姒莘 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 312求調(diào)劑 +4 | 陌宸希 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 293求調(diào)劑 +6 | 世界首富 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | p asserby. 2026-03-15 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +3 | 困于星晨 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[碩博家園] 深圳大學(xué)碩士招生（2026秋，傳感器方向，僅錄取第一志愿） +4 | xujiaoszu 2026-03-11 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 大米飯！ 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑，求各位老師收留 +8 | 秋有木北 2026-03-14 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 277材料科學(xué)與工程080500求調(diào)劑 +3 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +3 | 劉夢(mèng)微 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +4 | 這么名字咋樣 2026-03-14 | 6/300 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] 現(xiàn)在如何回避去年的某一個(gè)專家，不知道名字 +3 | zk200107 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 255求調(diào)劑 +3 | 李嘉慧， 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 學(xué)碩285求調(diào)劑 +13 | Wisjxn 2026-03-12 | 46/2300 |
|
|
|
[考研] 336求調(diào)劑 +6 | Iuruoh 2026-03-11 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 085600英一數(shù)二總分302 前三科235 精通機(jī)器學(xué)習(xí) 一志愿哈工大 +4 | 林yaxin 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求材料調(diào)劑 +5 | 隔壁陳先生 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿西南交大，材料專碩317求調(diào)劑 +5 | lx8568 2026-03-11 | 5/250 |
|