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【分享】PCR產(chǎn)物中減少引物二聚體的方法 已有33人參與
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1. 從引物自身著手,重新設(shè)計引物,這是最根本解決這一問題的辦法; 2. 可能模板有問題; 3. 模板濃度過小,適當(dāng)加大模板量; 4. Taq酶,引物,Mg2+濃度可能過高,可降低它們的濃度; 5. 取你所要加的上下游引物混合后,在100攝氏度下的沸水中煮5分鐘,然后迅速拿出至于冰塊之上瞬時冷卻,這時再加入反應(yīng)體系當(dāng)中,引物二聚體就會消失的; 6. 所配MIX中加5%的甘油或者5%的DMSO,可以增強(qiáng)特異性; 7. PCR反應(yīng)體系的配制在冰上進(jìn)行,最后加TAq酶,PCR結(jié)束后,產(chǎn)物勿放置在室溫下過長時間,有人認(rèn)為室溫下有些TAQ酶會將多余的引物合成為二聚體。 8. 增加循環(huán)數(shù); 9. 降低退火溫度后有條帶,則應(yīng)逐漸提高溫度,若提高溫度的同時產(chǎn)物量減少,則考慮增加鎂離子濃度(根據(jù)擴(kuò)增片斷長度而定,片段長則相應(yīng)鎂離子濃度應(yīng)該高一些); 10. 若降低退火溫度,發(fā)現(xiàn)還是只有引物二聚體,而且鎂離子的濃度在 20-25mmol/l沒有區(qū)別,則考慮Buffer等試劑沒有完全融解、混勻,導(dǎo)致吸取的試劑濃度不對。 11. 以上次的pcr產(chǎn)物作模板二次pcr,可以提高引物與模板的特異性,減少引物二聚體,如果兩次時間間隔短的話,可以把原產(chǎn)物稀釋100-1000倍,如果間隔較長可以稀釋50-100倍 |
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