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congmingbing木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助】用VMD怎樣顯示3D結(jié)構(gòu)的晶胞呢？ 已有2人參與
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把lammps的dump文件(dump.atom)導(dǎo)入vmd后，可以顯示三維晶體結(jié)構(gòu)圖，但是沒有晶胞，dump文件中已經(jīng)包含了box boundary,不知道怎樣可以在vmd中顯示unit cell呢？ 謝謝高手指點(diǎn)！！ |
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congmingbing
木蟲 (正式寫手)
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ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-07-19 10:14:55
congmingbing(金幣+2): 2010-07-19 13:28:42
ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-07-19 10:14:55
congmingbing(金幣+2): 2010-07-19 13:28:42
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加上 molinfo top set alpha a molinfo top set beta b molinfo top set gamma c a b c 為三個角 單位為度 如果嫌麻煩 直接用pbc set {x y z a b c} 就行了 我用的是VMD1.8.7 a軸一定得平行于VMD中的x軸，其它的就隨便了。 我已開始在做的時候沒遇到什么問題，你說的情況我還真不太清楚，你看看這個方法行不，這是師兄告訴我的。 |
4樓2010-07-19 10:09:14
congmingbing
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5樓2010-07-19 13:32:43
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