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flychang0506木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助】求助:基于連鎖不平衡原理的關聯(lián)分析中的一些問題
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各位蟲友,大家好: 基于連鎖不平衡的關聯(lián)分析是數(shù)量性狀位點挖掘的重要手段之一。在基于連鎖不平衡的關聯(lián)分析(LD-association)中,有幾個問題不明白,想請高手指點一下。 一個就是在基于全基因組掃描的時候,參考文獻上的群體一般都是品種、品系,在不同屬間、種間材料(群體很大)上是否可以運用LD-association方法? 另一個就是,在標記類型的選擇上,現(xiàn)有文獻一般都是基因組信息比較豐富的水稻、小麥、玉米、大豆、油菜等大田作物,多數(shù)利用的也都是基于序列的共顯性標記,有少數(shù)用AFLP。我想問的是,顯性標記(RAPD、ISSR、SRAP等)可以用于LD-association中嗎,會產生何種影響? 以上問題,還請各位高手不吝賜教,萬分感謝! |
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