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【求助】求教薛定諤軟件macromodel模塊模擬金屬配合物
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各位模擬達(dá)人，小弟求救！ 最近看韓國(guó)Benzimidazole-based ratiometric fluorescent receptor exhibiting molecular logic gate for Cu2+ and Fe3+這篇文章， 他們說小分子有機(jī)金屬配合物能夠用macromodel v9.0 mm*2 立場(chǎng)模擬，我的結(jié)構(gòu)是2個(gè)苯環(huán)，6個(gè)碳，2個(gè)氧，2個(gè)氮，氮與金屬鋅，銅，鐵配位，試了好多次，只要加一個(gè)金屬原子到分子中間的空間去，macromodel都報(bào)錯(cuò)，說有typ ca(5) 或者ca(27)的無機(jī)原子存在，目前不能用macromodel模擬，我問了韓國(guó)人，他說可以模擬，讓我試mmff立場(chǎng)，我試了還是不行，我把里邊的所有立場(chǎng)都試過了還是不行。 不知道是我軟件版本不對(duì)（我的mastro8.0 macromodel是v95109,問別人要的400多兆的bin文件用虛擬光驅(qū)安裝的），還是操作不對(duì)，還是韓國(guó)人忽悠我。。。。。 求各位大哥救命，告訴我用macromodel怎么模擬小分子金屬配合物結(jié)構(gòu)。。 |
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