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叔揚(yáng)新蟲 (初入文壇)
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【求助】國內(nèi)做蛋白質(zhì)核磁共振和X晶體衍射的單位 已有3人參與
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| 現(xiàn)須研究一個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)，請問國內(nèi)分別有哪些單位可以做蛋白質(zhì)的核磁共振和X晶體衍射？多謝幫助！ |
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yalefield
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到底是誰第一個(gè)發(fā)表SARS冠狀病毒主要蛋白酶晶體結(jié)構(gòu)和抑制劑
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
wsht212(金幣+3):謝謝交流 2010-07-30 09:19:11
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作者：Snoopy 昨日看到何士剛先生的《良禽擇木而棲》，提到饒子和院士對SARS 研究的重大貢獻(xiàn)，不禁有些疑惑。文中說“1996年從英國Oxford大學(xué)回到清華大學(xué)的饒子和，在蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)研究上作出了重要貢獻(xiàn)，第一個(gè)解出了 SARS冠狀病毒主要蛋白酶和其抑制劑的晶體結(jié)構(gòu)。現(xiàn)為中國科學(xué)院院士，中國科學(xué)院生物物理研究所所長。” 據(jù)我所知，這項(xiàng)功勞應(yīng)該歸功于現(xiàn)任德國呂貝克大學(xué)生物化學(xué)所所長的Rolf Hilgenfeld 教授。他的研究組從1998 年就與德國南部的醫(yī)藥公司合作開發(fā)治療流行性感冒的藥物，開始對流感冠狀病毒主要蛋白酶的晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究，通過計(jì)算機(jī)模擬篩選可能的抗病毒藥物。在 SARS爆發(fā)之前，他們已經(jīng)成功地構(gòu)建了流感冠狀病毒主要蛋白酶的晶體結(jié)構(gòu)[1]，還篩選出了幾個(gè)小分子藥物，由醫(yī)藥公司著手進(jìn)行前期試驗(yàn)。 這種計(jì)算機(jī)輔助的藥物篩選法在世界各地的藥物開發(fā)研究中早已得到廣泛應(yīng)用。不同的研究組各有側(cè)重， 針對不同的藥物靶點(diǎn)，因此Hilgenfeld 教授在SARS爆發(fā)前并非十分突出。例如呂貝克大學(xué)化學(xué)所的另一位教授也采用同樣的思路對肝炎病毒主要蛋白酶進(jìn)行研究。 SARS的流行是中國人的一場大難， 但卻給Hilgenfeld 教授帶來巨大的契機(jī)。主要從事這項(xiàng)研究的博士生Anand 歷經(jīng)5年才完成蛋白表達(dá)、結(jié)晶、建立計(jì)算機(jī)模型和幾個(gè)小分子篩選。 當(dāng)確定SARS病原后，他們欣喜地發(fā)現(xiàn)SARS冠狀病毒主要蛋白酶的結(jié)構(gòu)與他們已經(jīng)構(gòu)建好的流感冠狀病毒主要蛋白酶只有幾個(gè)氨基酸的差異，于是用稍作修改的已有模型馬上開始篩選。這就是為什么確定病原之后，他們馬上就能在Science 上發(fā)表轟動(dòng)性的成果的原因。“機(jī)遇只偏愛有準(zhǔn)備的頭腦”，Hilgenfeld 教授的經(jīng)歷就是這句話最好的印證。 加拿大科學(xué)家在2003年4月12日首先宣布解出冠狀病毒的基因序列，Hilgenfeld 教授的文章發(fā)表于2003 年5月[2]， 饒?jiān)菏康恼撐氖桥cHilgenfeld 教授合作后發(fā)表于2003年10月[3]。如果沒有Hilgenfeld 小組以前的工作積累，試問饒?jiān)菏空婺茉趲讉�(gè)月時(shí)間內(nèi)完成這么多工作嗎？雖說發(fā)了篇PNAS，可說到底也還只是步人后塵，何況還是與原作者合作的產(chǎn)物。 如果大家有興趣比較一下中文和英文古狗搜索“SARS，病毒主要蛋白酶”，就會(huì)發(fā)現(xiàn)中文媒體滿篇皆是“饒子和教授首先發(fā)現(xiàn)......”云云，英文媒體則只提到過Hilgenfeld 教授。如果真象他們自己吹噓的那樣，為什么關(guān)于這項(xiàng)研究的大獎(jiǎng)?lì)C給印度博士生Anand K， 而沒有發(fā)給貢獻(xiàn)杰出的清華高材生呢？ 其實(shí)，我并非第一次聽到這種他們第一的說法，只是因?yàn)榇嗽挸鲇陴堅(jiān)菏扛咄街冢艺J(rèn)為弟子難免為導(dǎo)師吹噓，也就罷了�？墒呛问縿傁壬幌驀�(yán)謹(jǐn)，我覺得有必要說個(gè)清楚。饒?jiān)菏吭趪鴥?nèi)是學(xué)界泰斗，正因?yàn)槿绱俗晕倚麄鲿r(shí)更應(yīng)該實(shí)事求是。您在中國比Hilgenfeld 教授不知神氣多少倍，何必還要用這種移花接木的手段呢。 1、Anand K, Palm GJ, Mesters JR, Siddell SG, Ziebuhr J, Hilgenfeld R. Structure of coronavirus main proteinase reveals combination of a chymotrypsin fold with an extra alpha-helical domain. EMBO J. 2002 Jul 1;21(13):3213-24. 2、Anand K, Ziebuhr J, Wadhwani P, Mesters JR, Hilgenfeld R. Coronavirus main proteinase (3CLpro) structure: basis for design of anti-SARS drugs. Science. 2003 Jun 13;300(5626):1763-7. Epub 2003 May 13. 3、Yang H, Yang M, Ding Y, Liu Y, Lou Z, Zhou Z, Sun L, Mo L, Ye S, Pang H, Gao GF, Anand K, Bartlam M, Hilgenfeld R, Rao Z. The crystal structures of severe acute respiratory syndrome virus main protease and its complex with an inhibitor. Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 Nov 11;100(23):13190-5. Epub 2003 Oct 29. |
3樓2010-07-29 20:22:13
yalefield
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評《到底是誰第一個(gè)發(fā)表SARS冠狀病毒主要蛋白酶晶體結(jié)構(gòu)和抑制劑》
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wsht212(金幣+2):謝謝交流，希望常來！ 2010-07-30 09:19:36
wsht212(金幣+2):謝謝交流，希望常來！ 2010-07-30 09:19:36
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SARS冠狀病毒蛋白酶確實(shí)由饒子和與Hilgenfeld共同首先解得并發(fā)表 因?yàn)镠ilgenfeld于2003年5月在Science上發(fā)表的是模擬的SARS冠狀病毒蛋白酶的結(jié)構(gòu)。真正的結(jié)構(gòu)幾個(gè)月后才在PNAS上發(fā)表。我不解的是為什么饒子和要和Hilgenfeld合作？合作中各自的角色是什么？ （JZ） 從 Hilgenfeld 的排名以及非通訊作者，很可能 Hilgenfeld 只是給于了一些不太重要的幫助。當(dāng)然，Hilgenfeld 的science文章對饒子和文章發(fā)表的重要性是不言而喻的，但因此把全部的功勞歸功于 Hilgenfeld而否定饒子和的工作，實(shí)在有點(diǎn)荒唐，難道說發(fā)現(xiàn) PCR 的功勞應(yīng)該全部給 DNA 聚合酶的發(fā)現(xiàn)者？Hilgenfeld 的功勞就在science文章，僅此而 已。 （xysReader） 也沒什么不妥 如果同源蛋白被解出來了，你再去做類似的工作，除非結(jié)構(gòu)上有顯著區(qū)別，否則根本無意義。讀一下Hilgenfeld和饒的文章就知道饒是在依葫蘆畫瓢。發(fā)PNAS已經(jīng)是沾光了。 （tomoe） |
4樓2010-07-29 20:22:35
yalefield
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wsht212(金幣+3):好好看看學(xué)習(xí)一下 2010-07-30 09:20:15
wsht212(金幣+3):好好看看學(xué)習(xí)一下 2010-07-30 09:20:15
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http://xys4.dxiong.com/xys/ebook ... dajia5/raozihe4.txt 對《到底是誰第一個(gè)發(fā)表SARS冠狀病毒主要蛋白酶晶體結(jié)構(gòu)和抑制劑》的幾點(diǎn)商榷 作者：Xneuron 看了Snoopy的《到底是誰第一個(gè)發(fā)表SARS冠狀病毒主要蛋白酶晶體結(jié)構(gòu)和抑制劑》，覺得有些地方值得商榷。 1）文章中提到“當(dāng)確定SARS病原后，他們欣喜地發(fā)現(xiàn)SARS冠狀病毒主要蛋白酶的結(jié)構(gòu)與他們已經(jīng)構(gòu)建好的流感冠狀病毒主要蛋白酶只有幾個(gè)氨基酸的差異，于是用稍作修改的已有模型馬上開始篩選”。 這個(gè)地方顯然是有問題的！在Hilgenfeld的Science文章中，他們解析了人類冠狀病毒229E Mpro和豬腸胃炎冠狀病毒229E Mpro抑制劑復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)。文中還提到229E Mpro 和229E Mpro與SARS冠狀病毒（他們表達(dá)的是TOR2株）的氨基酸序列一致性分別只有40％和44％。以229E Mpro為例，其分子量為33.1-kD，怎么著也得100個(gè)左右氨基酸的差別吧？怎么會(huì)是只有幾個(gè)氨基酸的差異�。孔鲆幌耣last，也會(huì)得出同樣的結(jié)果！ 2）這兩個(gè)蛋白有同源性，可以看作是一個(gè)家族的（rao的文章中提到了這一點(diǎn)）；他們?nèi)S結(jié)構(gòu)的確也非常相似，但是在SARS水解酶蛋白結(jié)構(gòu)解析出來以前，沒人可以肯定地下結(jié)論，而且Rao實(shí)驗(yàn)室還做了Complex的結(jié)構(gòu)，發(fā)現(xiàn)酶與底物的結(jié)合是一種全新的方式，與Rolf他們做的并不相同，所以他們文章發(fā)了以后，PNAS會(huì)為此專門開新聞發(fā)布會(huì)。另外，Hilgenfeld他們只是根據(jù)他們解析的上面提到的蛋白的結(jié)構(gòu)，構(gòu)建了SARS病毒的同源性模型（可能而已）！ 3） 在Rao的文章中，提到“Our crystal structures provide, to our knowledge, the first view of this viral protease, including the active site conformation.”！請注意，Hilgenfeld也是這篇文章的作者之一，他應(yīng)該是看過這篇文章的，他沒有提出異議，那么起碼我們可以認(rèn)為，他不反對如此的表述，對不對？原作者都沒有異議，看來snoopy該是打抱不平的了，呵呵！ 4） 印度博士生Anand K獲得的那個(gè)大獎(jiǎng)是什么大獎(jiǎng)？我google了一下，是不是Fonda-Fasella Award？這是什么樣子的大獎(jiǎng)？是歐洲的某個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng)？要不要申請？我真的不是很明白！而且似乎獲獎(jiǎng)?wù)呤窃?1月份左右確定的？剔除國別和人種歧視的因素，評獎(jiǎng)的時(shí)機(jī)該不是特別利于rao實(shí)驗(yàn)室的那位清華高才生吧？當(dāng)然，我不是說rao他們理應(yīng)得獎(jiǎng)，只是覺得覺得snoopy兄說得有失偏頗而已！ 總之，我認(rèn)為，這項(xiàng)榮譽(yù)歸于rao實(shí)驗(yàn)室是可以接受的，起碼是他們，而不是某個(gè)外國人或是機(jī)構(gòu)，最先直接解析了人類SARS病毒的結(jié)構(gòu)！ [ Last edited by yalefield on 2010-7-29 at 20:24 ] |
5樓2010-07-29 20:23:22
叔揚(yáng)
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6樓2010-07-30 10:37:58
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