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yexuqing木蟲之王 (文學(xué)泰斗)
太陽系系主任
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[交流]
【轉(zhuǎn)帖】科學(xué)家發(fā)明少量細(xì)胞多層次圖譜繪制新方法
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科學(xué)家發(fā)明少量細(xì)胞多層次圖譜繪制新方法 解析正常和病態(tài)生理過程的有力工具是全基因組分子遺傳和表觀遺傳圖譜。其中獲得細(xì)胞機(jī)能完整圖譜最主要的挑戰(zhàn)之一，就是開發(fā)出一種能夠描述少量細(xì)胞多層次圖譜特征的技術(shù)。最新一期《自然—方法學(xué)》（Nature Methods）發(fā)表的兩篇文章解決了這個(gè)問題。 在過去的15年里，出現(xiàn)了許多研究基因組圖譜的方法，包括從生物芯片到最新的單分子測(cè)序平臺(tái)。但是，由于每個(gè)器官由不同類型的細(xì)胞組成，而其中許多類型的細(xì)胞數(shù)量很少，這使得對(duì)細(xì)胞在表觀組和轉(zhuǎn)錄組水平圖譜的研究變得緩慢。 美國(guó)Helicos生物科學(xué)公司的Fatih Ozsolak及其同事發(fā)明了一種名為“少量數(shù)碼基因表達(dá)"（LQ-DGE）的新方法。作者利用該方法對(duì)少至250個(gè)的細(xì)胞不用擴(kuò)增就可以得到其mRNA圖譜。他們通過改善Helicos的DGE方法，即從poly(dT)包裹的流動(dòng)細(xì)胞上捕獲poly(A)+ mRNA，并直接在細(xì)胞表面完成cDNA合成與測(cè)序，減少了樣品操作并提高了樣品敏感性。 麻省陸軍總醫(yī)院的Bradley E Bernstein小組介紹了在有限小鼠造血祖細(xì)胞應(yīng)用的“結(jié)合高通量測(cè)序的染色質(zhì)免疫共沉淀”（ChIP-seq）方法。作者利用ChIP-seq繪制了1000個(gè)細(xì)胞的組蛋白修飾圖譜，從而了解了小鼠造血祖細(xì)胞的發(fā)育模式。 隨著技術(shù)提高，少量細(xì)胞多層次圖譜有望成為現(xiàn)實(shí)。我們有望看到特定細(xì)胞在全基因組水平的遺傳、基因表達(dá)、DNA和組蛋白修飾圖譜。（科學(xué)網(wǎng) 任春曉/編譯） 相關(guān)方法：“少量數(shù)碼基因表達(dá)”（LQ-DGE） “結(jié)合高通量測(cè)序的染色質(zhì)免疫共沉淀”（ChIP-seq） 完成人：Fatih Ozsolak課題組/Bradley E Bernstein課題組 實(shí)驗(yàn)室：美國(guó)Helicos生物科學(xué)公司 麻省陸軍總醫(yī)院與哈佛醫(yī)學(xué)院 |
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