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maad木蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】水的擴散系數(shù)計算
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用MD模擬基底的一到兩層水層，想要計算其中的水的擴散系數(shù)�？吹轿墨I(xiàn)中方法一般都是計算體系的均方位移（Mean square displacement ＭＳＤ），然后根據(jù)Einstein關(guān)系求得擴散系數(shù)。但是一些細(xì)節(jié)的處理摸了半天還是沒弄明白，比如計算均方位移時，是不是要將每一個水分子在不同的時間間隔delta t時間內(nèi)的均方位移求出來，然后取平均。最后得到是這個平均均方位移與時間間隔delta t（比如從1ps到100ps）的一個近似線性的曲線，它的斜率即為擴散系數(shù)？ 由于是第一次接觸這個公式，描述的可能有點不清楚。希望算過的大俠幫忙指導(dǎo)一下，如果有代碼段，可否借我參考一下，謝啦。 |
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