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【獎(jiǎng)勵(lì)】本帖被評(píng)價(jià)41次，作者bnuxin增加金幣 32.8 個(gè)

bnuxin

銀蟲 (小有名氣)

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[資源] 【資源】施一公談學(xué)生如何閱讀和寫作論文已有7人參與

本來(lái)想發(fā)在論文投稿，看了看感覺不合適，還是回到老根據(jù)地，納米這邊吧，呵呵
施一公先生寫的學(xué)生如何閱讀論文和提高寫作能力
我感覺很好，歡迎大家討論，呵呵

http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=350496

【序：此文針對(duì)本科生和一、二年級(jí)的博士、碩士生，對(duì)高年級(jí)的博士生和博士后也應(yīng)該有參考價(jià)值。該文的一些背景可以參考我此前關(guān)于提高英文寫作能力的博文： http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=349932】

從小到大，我感性思維多一些，不善于讀書。85至89年在清華生物系讀本科期間，從未讀過(guò)任何一種英文專業(yè)期刊。我受到的與英文閱讀相關(guān)的訓(xùn)練一共只有兩個(gè)。一是我在1986年暑假期間選修的時(shí)任系主任的蒲慕明老師開設(shè)的《生物英語(yǔ)》系列講座，隱隱約約記得蒲先生讓我們閱讀一些諸如DNA雙螺旋發(fā)現(xiàn)之類的科普性英文文章，很有意思。但時(shí)間較短，暑假過(guò)后也沒有養(yǎng)成讀英文文章的習(xí)慣。二是《生物化學(xué)》這門課。與現(xiàn)在的清華生命學(xué)院形成鮮明對(duì)比，我上大學(xué)期間的所有基礎(chǔ)課和專業(yè)課都是采用中文教材、中文講課，只有鄭昌學(xué)老師講授的《生物化學(xué)》采用了Lehninger的《Principles of Biochemistry》，而且鄭老師要求我們每個(gè)學(xué)生每次課后閱讀10-20頁(yè)教材。我們同學(xué)大多感覺到專業(yè)英文閱讀有所提高。

1990年4月至7月初，我在依阿華州Ames小鎮(zhèn)的Iowa State University度過(guò)了初到美國(guó)的前三個(gè)月，其中大部分時(shí)間在Herbert Fromm教授的實(shí)驗(yàn)室做輪轉(zhuǎn)（rotation），跟隨劉峰和董群夫妻兩人做研究（劉峰現(xiàn)在University of Texas Health Science Center做教授）。當(dāng)時(shí)感覺最困難的就是讀專業(yè)論文。有一次，F(xiàn)romm教授要求我在組會(huì)上講解一篇《Journal of Biological Chemistry》的文章，我提前兩天開始閱讀，第一遍花了足足六個(gè)小時(shí)，許多生詞只能依靠英漢詞典，文章中的有些關(guān)鍵內(nèi)容還沒有完全讀懂，當(dāng)時(shí)的感覺是JBC的文章怎么這么長(zhǎng)、這么難懂？！真有點(diǎn)苦不堪言。為了能給Fromm教授和師兄師姐留下好印象，第二天又花了好幾個(gè)小時(shí)讀第二遍，還做了總結(jié)。第三天我在組會(huì)上的表現(xiàn)總算沒有給清華丟臉。但是，前前后后，真搞不清楚自己為了這一篇文章到底花了多少時(shí)間！

90年7月我轉(zhuǎn)學(xué)到約翰霍普金斯大學(xué)以后，與本科來(lái)自北大的虞一華同在IPMB program。虞一華大我一歲，來(lái)巴爾地摩之前已經(jīng)在夏威夷大學(xué)讀了一年的研究生，對(duì)于科研論文的閱讀比我強(qiáng)多了。他常常在IPMB的辦公室里拿著《科學(xué)》和《自然》周刊津津有味地閱讀，看得我很眼饞，也不理解其中那些枯燥的文章有什么意思。他告訴我：他在讀很有意思的科學(xué)新聞�？茖W(xué)新聞能有什么意思？虞一華給我講了好幾個(gè)故事：洛克菲勒大學(xué)校長(zhǎng)諾貝爾獎(jiǎng)得主David Baltimore如何深陷泥潭、人類基因組測(cè)序如何爭(zhēng)辯激烈、HIV病毒究竟是誰(shuí)發(fā)現(xiàn)的，等等。我還真沒有想到學(xué)術(shù)期刊上會(huì)有這么多我也應(yīng)該看得懂的內(nèi)容！從那時(shí)起，每一期新的《科學(xué)》和《自然》一到，我也開始嘗試著閱讀里面的新聞和研究進(jìn)展介紹，這些內(nèi)容往往出現(xiàn)在“News & Comment”“Research News”“News & Views”“Perspectives”等欄目，文筆平實(shí)，相對(duì)于專業(yè)的科研論文很容易讀懂。有時(shí)，我還把讀到的科研新聞講給我的同事朋友們聽，而同事的提問和互動(dòng)對(duì)我又是更好的鼓勵(lì)。除了《科學(xué)》和《自然》，我也常常翻看《科學(xué)美國(guó)人》(“Scientific American”)。

與《細(xì)胞》(Cell)、《生物化學(xué)期刊》（JBC）等非常專業(yè)的期刊不同，《科學(xué)》和《自然》里面有相當(dāng)一部分內(nèi)容是用來(lái)做科普教育的�！犊茖W(xué)》周刊的“Perspectives”和《自然》周刊的“News & Views”欄目都是對(duì)重要科學(xué)論文的深入淺出的介紹，一般1-3頁(yè)，讀起來(lái)比較通俗易懂，較易入門。讀完這些文章后，再讀原始的科學(xué)論文，感覺好多了！而且可以把自己的體會(huì)與專家的分析比較一下，找找差距，有時(shí)甚至也能找回來(lái)一點(diǎn)自信！

從1998年在普林斯頓大學(xué)任職到現(xiàn)在清華大學(xué)做教授，我總是告訴自己實(shí)驗(yàn)室的所有年輕人（包括本科生、碩士生、博士生、博士后）下面這幾點(diǎn)讀科研論文的體會(huì)，也希望我的學(xué)生跟我學(xué)：

1．請(qǐng)每位學(xué)生每周關(guān)注《科學(xué)》和《自然》。（生命科學(xué)界的學(xué)生還應(yīng)該留心《細(xì)胞》）。如果時(shí)間有限，每周花一個(gè)小時(shí)讀讀這兩種周刊里的文章標(biāo)題以及與自己研究領(lǐng)域相關(guān)的科研論文的abstract,即可！這樣做可以保證一個(gè)學(xué)生基本上能夠跟蹤本領(lǐng)域最重要的發(fā)現(xiàn)和進(jìn)展，同時(shí)開闊視野，大概知道其它領(lǐng)域的動(dòng)態(tài)。

2．在時(shí)間充足的情況下，可以細(xì)讀《科學(xué)》和《自然》里的新聞及科研論文。如果該科研論文有“News & Views”或“Perspectives”來(lái)介紹，請(qǐng)先讀這些文章，這類導(dǎo)讀的文章會(huì)提煉問題，就好比是老師事先給學(xué)生講解一番論文的來(lái)龍去脈，對(duì)學(xué)生閱讀原始論文有很大幫助。

3．在讀具體的科研論文時(shí)，最重要的是了解文章的主線邏輯。文章中的所有Figures都是按照這個(gè)主線邏輯展開描述的。所以，我一般先讀“introduction”部分，然后很快地看一遍Figures。大概知道這條主線之后，才一字一句地去讀“results”和“discussion”。

4．當(dāng)遇到一些實(shí)驗(yàn)或結(jié)果分析很晦澀難懂時(shí)，不必花太多時(shí)間深究，而力求一氣把文章讀完。也許你的問題在后面的內(nèi)容中自然就有解答。這與聽學(xué)術(shù)講座非常相似！你如果想每個(gè)細(xì)節(jié)都聽懂，留心每一個(gè)技術(shù)細(xì)節(jié)，那你聽學(xué)術(shù)講座不僅會(huì)很累，而且也許會(huì)為了深究一個(gè)小技術(shù)環(huán)節(jié)而影響了對(duì)整個(gè)講座邏輯推理及核心結(jié)論的理解。

5．對(duì)個(gè)別重要的文章和自己領(lǐng)域內(nèi)的科研論文，應(yīng)該精讀。對(duì)與自己課題相關(guān)的每一篇論文則必須字斟句酌地讀。這些論文，不僅要完全讀懂，理解每一個(gè)實(shí)驗(yàn)的細(xì)節(jié)、分析、結(jié)論，還必須聯(lián)想到這些實(shí)驗(yàn)和結(jié)論對(duì)自己的課題的影響和啟發(fā)，提出自己的觀點(diǎn)。

6．科學(xué)論文的閱讀水平是循序漸進(jìn)的。每個(gè)人開始都會(huì)很吃力，所以你有這種感覺不要?dú)怵H。堅(jiān)持很重要，你一定會(huì)漸入佳境。當(dāng)你有問題時(shí)或有絕妙分析時(shí)，應(yīng)該與師兄師姐或找導(dǎo)師討論。

7．科研訓(xùn)練的一個(gè)重要組成部分就是科研論文的閱讀。每一個(gè)博士生必須經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的科研論文閱讀的訓(xùn)練。除了你自己的習(xí)慣性閱讀外，你應(yīng)該在研究生階段選修以閱讀分析專業(yè)文獻(xiàn)為主的一至兩門課，在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)也要有定期的科研論文討論（Journal Club）。如果你的實(shí)驗(yàn)室還沒有這種討論，你們學(xué)生可以自發(fā)地組織起來(lái)。

8．前面幾條都是討論如何提高科研論文的閱讀能力，但是一旦入了門，就要學(xué)會(huì)critical reading。不要迷信已發(fā)表的論文，哪怕是發(fā)表在非常好的期刊上。要時(shí)刻提醒自己：該論文邏輯是否嚴(yán)謹(jǐn)，數(shù)據(jù)是否可靠，實(shí)驗(yàn)證據(jù)是否支持結(jié)論，你是否能想出更好的實(shí)驗(yàn)，你是否可以在此論文的基礎(chǔ)上提出新的重要問題？等等。

天外有天，讀科研論文是一件很簡(jiǎn)單、但也很深?yuàn)W的事情。一般的學(xué)生常常滿足于讀懂、讀透一篇好的論文，優(yōu)秀的學(xué)生則會(huì)舉一反三、通過(guò)查找references縱深了解整個(gè)領(lǐng)域的歷史、現(xiàn)狀，并展望該領(lǐng)域未來(lái)的可能進(jìn)展。

我從1990年對(duì)學(xué)術(shù)論文一竅不通到96年博士后期間的得心應(yīng)手，還常常幫助同事分析，自以為水平了得。但是有一件事讓我看到了自己的嚴(yán)重不足，頗為羞愧。1996年，是SMAD蛋白發(fā)現(xiàn)及TGF-b信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究的最激動(dòng)人心的一年，哈佛醫(yī)學(xué)院的Whitman實(shí)驗(yàn)室在十月份的《自然》雜志上以“Article”的形式發(fā)表了一篇名為“A transcriptional partner for MAD proteins in TGF-b signaling”的文章。讀完之后，正好遇到TGF-b領(lǐng)域的著名學(xué)者Joan Massague,我對(duì)Joan評(píng)論說(shuō)：I’m not so sure why this paper deserves a full article in Nature. They just identified another Smad-interacting protein, and the data quality is mediocre. 完全出乎我的意料，Joan馬上回應(yīng)我：I disagree! This paper links the cytoplasmic Smad protein into the nucleus and identifies a transcription factor as its interacting protein. Now the TGF-b signaling pathway is complete. It is a beautiful Nature article! 這件事對(duì)我觸動(dòng)極大：原來(lái)大師的視野和品位遠(yuǎn)遠(yuǎn)在我之上。從那以后，我也開始從整個(gè)領(lǐng)域的發(fā)展方面來(lái)權(quán)衡一篇文章的重要性，這件事對(duì)我今后為國(guó)際重要學(xué)術(shù)期刊審稿、自己實(shí)驗(yàn)室選擇研究課題都起到了相當(dāng)重要的作用。

如今，我閱讀一篇本領(lǐng)域內(nèi)的科研論文，非常順利，而且常常可以看出一些作者沒有想到或分析到的關(guān)鍵點(diǎn)�；叵霃那�，感慨萬(wàn)千，感謝蒲慕明、鄭昌學(xué)、虞一華、John Desjarlais、Jeremy Berg、Joan Massague等一批老師和同事對(duì)我的幫助。我很留心，也很用心。

希望所有的學(xué)生也能通過(guò)努力和堅(jiān)持對(duì)英文科研論文的閱讀得心應(yīng)手！

如何提高英文的科研寫作能力
http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=349932

作為一個(gè)科研工作者，在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表科研論文是與同行交流、取得國(guó)際影響的必經(jīng)之路。有些國(guó)內(nèi)的科學(xué)家，實(shí)驗(yàn)做得很漂亮，但常�？鄲烙谡撐牡膶懽髁Σ粡男模蔀閲�(guó)際交流的一大障礙。本文從博主的親身體驗(yàn)出發(fā)，給博士生、博士后、以及年輕的PI提供一個(gè)借鑒。文章最后做簡(jiǎn)短總結(jié)。

我大學(xué)時(shí)的同班同學(xué)都知道，那時(shí)我的英語(yǔ)不算好（英語(yǔ)四級(jí)考試僅為“良”），寫作尤其糟糕。初到美國(guó)之時(shí)，對(duì)英文環(huán)境適應(yīng)得很差，讀一篇JBC的文章要五、六個(gè)小時(shí)，還常常不理解其中一些關(guān)鍵詞句的意思,心里壓力極大。

很幸運(yùn)，我在約翰霍普金斯大學(xué)（Johns Hopkins University）攻讀博士學(xué)位時(shí)，1991年4月遇到了學(xué)兄和啟蒙老師John Desjarlais。聽了我的苦惱后，John告訴我，“Spend 45 minutes every day reading Washington Post, and you will be cruising with your written English in two years”(每天花45分鐘讀《華盛頓郵報(bào)》,兩年后你的寫作能力會(huì)得心應(yīng)手)。這條建議正合我意 - 我原本就對(duì)新聞感興趣！于是，我每天上午安排完第一批實(shí)驗(yàn)后，都會(huì)在十點(diǎn)左右花一小時(shí)的時(shí)間閱讀《華盛頓郵報(bào)》，主要看A版(新聞版)。剛開始，我一個(gè)小時(shí)只能讀兩、三個(gè)短消息或一個(gè)長(zhǎng)篇報(bào)道，中間還不得不經(jīng)常查字典看生詞。但不知不覺間，我的閱讀能力明顯提高，1992年老布什與克林頓競(jìng)選總統(tǒng)，我跟蹤新聞，常常一個(gè)小時(shí)能讀上幾個(gè)版面的消息或四、五個(gè)長(zhǎng)篇報(bào)道，有時(shí)還把剛看到的新聞繪聲繪色地講給師兄師姐聽。

閱讀直接提升了我的英文寫作能力�？赐暌恍┬侣労螅页３．a(chǎn)生動(dòng)筆寫自己感想的沖動(dòng)。92年巴塞羅那奧運(yùn)會(huì)，中國(guó)游泳隊(duì)取得了四金五銀的好成績(jī)，美國(guó)主要媒體紛紛指責(zé)這是中國(guó)運(yùn)動(dòng)員服用違禁藥物，但沒有任何檢測(cè)的證據(jù)，完全憑美國(guó)運(yùn)動(dòng)員的感覺。此事讓我很氣憤，我生平第一次給《華盛頓郵報(bào)》和《巴爾的摩太陽(yáng)報(bào)》（The Baltimore Sun）各寫了一封信，評(píng)論報(bào)道的不公平。沒想到兩天后《巴爾的摩太陽(yáng)報(bào)》居然原封不動(dòng)的把我的信刊登在“讀者來(lái)信”欄目，同事祝賀，我也洋洋得意。受到此事鼓勵(lì)，我在此后三年多的日子里，常常動(dòng)筆，有些文章發(fā)表在報(bào)刊上（大部分投稿石沉大海），也曾代表中國(guó)留學(xué)生寫信向校方爭(zhēng)取過(guò)中國(guó)學(xué)生的利益。有時(shí)還有意外的驚喜。95年的一天，一位朋友打電話告訴我：今天出版的《巴爾的摩太陽(yáng)報(bào)》上有我的評(píng)論文章！我急匆匆趕到街頭買來(lái)5份報(bào)紙，果然，在A版的倒數(shù)第二頁(yè)，以15x15厘米的篇幅發(fā)表了我一個(gè)多星期前寄給報(bào)社、本以為不會(huì)發(fā)表的一篇抨擊吳宏達(dá)的文章。

以上是簡(jiǎn)述我個(gè)人英文寫作提升的一段過(guò)程。但是，科研論文不同于讀者來(lái)信，有其專業(yè)特點(diǎn)、甚至是固定格式。1994年，我第一次完整地寫科研論文，感覺很差。好不容易寫完的文章，連我自己都不愿意讀第二遍；勉強(qiáng)修改之后，交給了老板Jeremy Berg。他拖了三周沒看我的文章，我實(shí)在忍不住了、去催他，上午9點(diǎn)，Jeremy告訴我：今天看！11點(diǎn)，我去他辦公室催，秘書攔住我，說(shuō)Jeremy正在辦理重要事務(wù)，兩點(diǎn)前不得打擾。我心里惴惴，不知Jeremy在干什么。下午一點(diǎn)半，Jeremy急匆匆過(guò)來(lái)找我，拿了一疊紙， “This is the draft. Please let me know what you think. We can aim for a Science report.”（這是初稿，你看看如何，我們可以試試《科學(xué)》）我仔細(xì)一看，天�。∫还�7頁(yè)，四個(gè)多小時(shí)Jeremy已經(jīng)把文章的整體寫完了，只是缺少M(fèi)ethod和 references。讓我郁悶的是，他根本沒有用我的初稿。

【其實(shí)，寫文章貴在一氣呵成。我也沿襲了Jeremy的風(fēng)格。2006年10月，在我們處于劣勢(shì)的激烈競(jìng)爭(zhēng)中，有兩個(gè)課題面臨被 scoop的危險(xiǎn)，我曾經(jīng)兩次、一晚上趕一篇文章。10月15日，傍晚8點(diǎn)左右開始寫、通宵，第二天早晨10點(diǎn)完成一篇按照《細(xì)胞》雜志格式的論文，包括abstract, introduction, results, discussion,仔細(xì)閱讀一遍后于下午4點(diǎn)半完成網(wǎng)上投稿。這篇文章最終發(fā)表在12月份《自然》的子刊《結(jié)構(gòu)與分子生物學(xué)》上（電子版于11月10日發(fā)表）。另一篇，10月18日，晚6點(diǎn)開始寫、通宵，第二天早晨8點(diǎn)完成，上午9點(diǎn)半完成投稿，最終發(fā)表在12月15日的《細(xì)胞》上。當(dāng)然，能通宵完成一篇文章，還有一個(gè)重要前提，就是對(duì)研究領(lǐng)域非常熟悉，對(duì)文章整體的大概思路已經(jīng)深思熟慮，所有的Figures都事先做好了。這些前期工作即使全身心投入也需要3-4天。】

從1994年自己寫第一篇科研論文的艱難到現(xiàn)在寫起來(lái)得心應(yīng)手、駕輕就熟，我總結(jié)出如下經(jīng)驗(yàn)：

1．要寫好科研論文，必須先養(yǎng)成讀英文文章的習(xí)慣，爭(zhēng)取每天30-60分鐘。剛開始可以選擇以讀英文報(bào)紙、英文新聞為主，逐漸轉(zhuǎn)為讀專業(yè)雜志。我會(huì)在近期專門寫一篇博客文章介紹一套行之有效的增強(qiáng)讀專業(yè)雜志能力的辦法。

2．寫科研論文，最重要的是邏輯。邏輯的形成來(lái)自對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的總體分析。必須先討論出一套清晰的思路，然后按照思路來(lái)做圖(Figures)，最后才能執(zhí)筆。

3．具體寫作時(shí)，先按照思路（即Figures）寫一個(gè)以subheading為主的框架，然后開始具體寫作。第一稿，切忌追求每一句話的完美，更不要追求詞語(yǔ)的華麗，而主要留心邏輯（logic flow），注意前后句的邏輯關(guān)系、相鄰兩段的邏輯關(guān)系。寫作時(shí)，全力以赴，盡可能不受外界事情干擾（關(guān)閉手機(jī)、座機(jī)），爭(zhēng)取在最短時(shí)間內(nèi)拿出第一稿。還要注意：一句話不可太長(zhǎng)。

4．學(xué)會(huì)照葫蘆畫瓢。沒有人天生會(huì)寫優(yōu)秀的科研論文，都是從別人那里學(xué)來(lái)的。學(xué)習(xí)別人的文章要注意專業(yè)領(lǐng)域的不同，有些領(lǐng)域（包括我所在的結(jié)構(gòu)生物學(xué)）有它內(nèi)在的寫作規(guī)律。科研文章里的一些話是定式，比如 “To investigate the mechanism of …, we performed …”, “These results support the former, but not the latter, hypothesis …”, “Despite recent progress, how … remains to be elucidated …” 等等。用兩次以后，就逐漸學(xué)會(huì)靈活運(yùn)用了。在向別人學(xué)習(xí)時(shí)，切忌抄襲。在美國(guó)一些機(jī)構(gòu)，連續(xù)7個(gè)英文單詞在一起和別人的完全一樣，原則上就被認(rèn)為抄襲（plagiarism）。

5．第一稿寫完后，給自己不要超過(guò)一天的休息時(shí)間，開始修改第二稿。修改時(shí)，還是以邏輯為主，但對(duì)每一句話都要推敲一下，對(duì)abstract和正文中的關(guān)鍵語(yǔ)句要字斟句酌。學(xué)會(huì)用“Thesaurus”（同義詞替換）以避免過(guò)多重復(fù)。第二稿的修改極為關(guān)鍵，再往后就不會(huì)大改了。

6．第二稿以后的修改，主要注重具體的字句，不會(huì)改變整體邏輯了。投稿前，一定要整體讀一遍，對(duì)個(gè)別詞句略作改動(dòng)。記�。簩W(xué)術(shù)期刊一般不會(huì)因?yàn)榫唧w的語(yǔ)法錯(cuò)誤拒絕一篇文章，但一定會(huì)因?yàn)檫壿嫽靵y而拒絕一篇文章。

這套方法行之有效，我對(duì)所有的學(xué)生和博士后都會(huì)如此教導(dǎo)。我的第一個(gè)博士后是柴繼杰，1999年加入我在普林斯頓大學(xué)的實(shí)驗(yàn)室。繼杰當(dāng)時(shí)的英文閱讀和寫作能力很差。我對(duì)他的第一個(gè)建議就是，“每天花半小時(shí)讀英文報(bào)紙”。難能可貴的是：他堅(jiān)持下來(lái)了！經(jīng)過(guò)幾年的努力，2004年繼杰已經(jīng)能寫出不錯(cuò)的grant proposal，2006年他的第一篇獨(dú)立科研論文發(fā)表在《Molecular Cell》上，隨后相繼在《自然》發(fā)表兩篇、在其它一流學(xué)術(shù)期刊發(fā)表十多篇論文。寫作能力開始成熟。

發(fā)表論文是一件值得高興的事情，但要明白：論文只是一個(gè)載體，是為了向同行們宣告你的科研發(fā)現(xiàn)，是科學(xué)領(lǐng)域交流的重要工具。所以，在科研論文寫作時(shí)，一定要謹(jǐn)記于心的就是：用最簡(jiǎn)單的話表達(dá)最明白的意思，但一定要邏輯嚴(yán)謹(jǐn)！其實(shí)，中文和英文論文皆如此！

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