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賀儀鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[交流]
【求助】vasp安裝問題 已有5人參與
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大家好！我在編譯vasp時出現(xiàn)如下偶的錯誤，系統(tǒng)是Ubuntu10.04，IFC，mkl，都是Intel編譯套裝，openmpi 串行時： /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_barrier' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_critical' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_ok_to_fork' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_end_critical' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_dispatch_init_8' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_global_thread_num' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_serialized_parallel' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_end_ordered' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_fork_call' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_dispatch_next_8' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_for_static_fini' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `omp_get_num_procs' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `omp_get_max_threads' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_ordered' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `omp_get_thread_num' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_for_static_init_4' /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.so: undefined reference to `__kmpc_for_static_init_8' make: *** [vasp] Error 1 并行的時候也出錯： b -ldmy ../vasp.5.lib/linpack_double.o ../vasp.4.lib/lapack_double.o -lmkl_lapack -Wl,--start-group /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel.a /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel_thread.a /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_core.a -Wl,--end-group -lguide -lpthread g77: fftmpi.o: No such file or directory g77: fftmpi_map.o: No such file or directory g77: ../vasp.4.lib/lapack_double.o: No such file or directory g77: /opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t/libmkl_intel.a: No such file or directory mpif77: No such file or directory make: *** [vasp] Error 1 Makefile文件下面給出。麻煩大家?guī)臀曳治觥?br /> [ Last edited by 賀儀 on 2010-8-17 at 18:21 ] |
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9樓2010-08-18 10:07:39
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串行的Makefile，只寫了關(guān)鍵部分： FC=ifort # fortran linker FCL=$(FC) CPP = $(CPP_) -DHOST=\"LinuxIFC\" \ -Dkind8 -DCACHE_SIZE=16000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGXhalf \ -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV \ -DNOZTRMM FFLAGS = -FR -lowercase -assume byterecl BLAS=-L/opt/intel/mkl/10.0.4.023/lib/em64t -lmkl -lpthread LAPACK= ../vasp.5.lib/lapack_double.o LIB = -L../vasp.5.lib -ldmy \ ../vasp.5.lib/linpack_double.o $(LAPACK) \ $(BLAS) FFT3D = fft3dfurth.o fft3dlib.o |
2樓2010-08-17 18:15:04
賀儀
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并行部分： 前面的都注釋了 FC=mpif77（服務(wù)器沒有mpif90） FCL=$(FC) CPP = $(CPP_) -DMPI -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \ -Dkind8 -DCACHE_SIZE=16000 -DPGF90 -Davoidalloc -DNGZhalf \ -DMPI_BLOCK=8000 \ -DRPROMU_DGEMV -DRACCMU_DGEMV \ -DNOZTRMM -DSCALAPACK（這一段火來加的，加了沒影響） LIB = -L../vasp.5.lib -ldmy \ ../vasp.5.lib/linpack_double.o \ $(LAPACK) \ $(SCA) $(BLAS) FFT3D = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dfurth.o fft3dlib.o |
3樓2010-08-17 18:18:26
zzy870720z
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