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【求助】高人指點DS2.5CDOCKER 已有3人參與
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| 我在做CDOCKER分子對接，總感覺結(jié)果中的10個poses奇奇怪怪的，肯定不是優(yōu)勢構(gòu)想，請問在做對接之前，小分子除了加氫之外還要經(jīng)過其他手段處理�。� 請解釋一下，小弟菜鳥。 |
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2樓2010-08-18 16:01:28
  ^^ |
3樓2010-08-19 09:44:18
4樓2010-08-19 15:29:12
5樓2010-08-19 15:30:30
tjegg
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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6樓2010-08-19 15:42:36
7樓2010-08-19 15:47:03
ostril
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★ ★ ★
asd1zxc(金幣+5):非常感謝，你真是熱心的人啊，這方面好多都不懂，一頭霧水，大哥能介紹個好的學(xué)習(xí)方法嗎，分子模擬論壇的人太少了，發(fā)了帖子都沒人理 2010-08-19 22:55:04
ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-08-20 14:58:00
asd1zxc(金幣+5):非常感謝，你真是熱心的人啊，這方面好多都不懂，一頭霧水，大哥能介紹個好的學(xué)習(xí)方法嗎，分子模擬論壇的人太少了，發(fā)了帖子都沒人理 2010-08-19 22:55:04
ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-08-20 14:58:00
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其實畫完后直接加立場就可以，在加力場同時就會加氫了，然后在simulation里有minimization,設(shè)置為2000步， 0.05步長優(yōu)化一下，基本就可以了. 另外，活性位點的球半徑要設(shè)置適合你的化合物，太小或者太大對于你最后的結(jié)果也是有影響的。 希望對你有點幫助。 |
8樓2010-08-19 22:10:01
ostril
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9樓2010-08-20 14:46:26
chemozhang
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10樓2011-09-05 20:16:56
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