田菊梅

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我在進(jìn)行晶體的check時(shí)，A類錯(cuò)誤說
Alert level A
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X    H2A ..  H2WB ..    1.79 Ang.
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X    H2C ..  H2WB ..    1.36 Ang.
PLAT052_ALERT_1_A (Proper) Absorption Correction Method Missing ..       ?
PLAT053_ALERT_1_A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT054_ALERT_1_A Medium  Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT055_ALERT_1_A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........       ?
PLAT223_ALERT_4_A Large Solvent/Anion  H    Ueq(max)/Ueq(min) ...    7.64 Ratio
特別是第一個(gè)，第二個(gè)，和最后一個(gè)不知道怎么弄，我也有固定了鍵長，但還是不行。怎么辦？朋友們支支招，感激不盡呀！�。�！

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1樓 2010-09-09 07:41:13

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southsea313

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田菊梅(金幣+2): 2010-09-09 08:47:15
eeqeeq0002(金幣+1):謝謝　參與 2010-09-09 15:01:09

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2樓2010-09-09 08:28:35

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huahua1216

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田菊梅(金幣+1): 2010-09-09 08:47:22
eeqeeq0002(金幣+1):謝謝　參與 2010-09-09 15:01:17

第一二個(gè)可能是氫加的不對(duì) 刪掉重新加
最后一個(gè)有可能是溶劑無序造成的

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3樓2010-09-09 08:42:57

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田菊梅

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PLAT053_ALERT_1_A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT054_ALERT_1_A Medium  Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT055_ALERT_1_A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M Given ........       ?
前面3個(gè)是晶體尺寸，CIF表里填寫好或者在INS文件里加SIZE * * *，第四個(gè)停歇CIF表能搞定
本文來自: 小木蟲論壇 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2380035

樓主能不能具體點(diǎn)，我還是個(gè)新手，固定了鍵長  還是沒能改善這個(gè)錯(cuò)誤

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4樓2010-09-09 08:48:34

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田菊梅

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第一二個(gè)可能是氫加的不對(duì) 刪掉重新加
最后一個(gè)有可能是溶劑無序造成的
本文來自: 小木蟲論壇 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=2380035&pid=97660&page=1#pid97660

我剛開始也這么認(rèn)為，以為是氫加錯(cuò)了，我也刪了重來過，但還是這樣，怎么辦？溶劑的無序造成的，我應(yīng)該怎么糾正呢？

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5樓2010-09-09 08:50:36

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田菊梅

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我是為新手，希望樓主朋友能夠詳細(xì)點(diǎn)，真是感謝大家了

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6樓2010-09-09 08:52:31

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cfocus20

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田菊梅(金幣+5): 2010-09-09 12:19:06
eeqeeq0002(金幣+1):謝謝　參與 2010-09-09 15:01:32
田菊梅(金幣+1): 2010-10-18 14:13:09

PLAT052_ALERT_1_A (Proper) Absorption Correction Method Missing ..       ?
在cif 檔內(nèi)填入相關(guān)吸收校正方法(先找到這項(xiàng))

PLAT053_ALERT_1_A Minimum Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT054_ALERT_1_A Medium  Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
PLAT055_ALERT_1_A Maximum Crystal Dimension Missing (or Error) ...       ?
以上三個(gè)在ins 檔內(nèi)加入 SIZE 0.3 0.2 0.1 (此數(shù)值是根據(jù)你晶體大小)

PLAT122_ALERT_1_A No _symmetry_space_group_name_H-M
Given ........       ?

在cif 檔內(nèi)加入你的space group( 先找到這項(xiàng)在後面填入)

PLAT223_ALERT_4_A Large Solvent/Anion  H    Ueq(max)/Ueq(min) ...    7.64 Ratio
此項(xiàng)應(yīng)該你還有其他大Q 峰未解決

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Smart_work_and_beautiful_life!

7樓2010-09-09 11:27:26

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yytsnake

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學(xué)習(xí)了，但關(guān)鍵是第一、二 _ALERT應(yīng)該如何應(yīng)對(duì)？這好象是我這初學(xué)者今后也會(huì)遇到的問題，而且是很難解決的問題，還望諸位大俠和前輩指教一二。

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8樓2010-09-09 13:27:29

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引用回帖:

Originally posted by yytsnake at 2010-09-09 13:27:29:
學(xué)習(xí)了，但關(guān)鍵是第一、二 _ALERT應(yīng)該如何應(yīng)對(duì)？這好象是我這初學(xué)者今后也會(huì)遇到的問題，而且是很難解決的問題，還望諸位大俠和前輩指教一二。

應(yīng)該還是氫加的不對(duì) 如果是是c上的可以考慮理論加氧上的氫最好結(jié)合氫鍵來加最后一個(gè)有可能是你溶劑的氫的Ueq沒有固定為母原子相應(yīng)的倍數(shù)

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9樓2010-09-09 13:54:54

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引用回帖:

Originally posted by huahua1216 at 2010-09-09 13:54:54:

應(yīng)該還是氫加的不對(duì) 如果是是c上的可以考慮理論加氧上的氫最好結(jié)合氫鍵來加最后一個(gè)有可能是你溶劑的氫的Ueq沒有固定為母原子相應(yīng)的倍數(shù)

現(xiàn)在我想學(xué)的就是O原子上加H的應(yīng)用原則問題。還望大俠指教，假定一個(gè)水為配位水，另一個(gè)水分子就在其附近，比如距離大約為2.8左右。我想知道應(yīng)該先給誰加H？配位O？或游離O？如果無殘基Q峰要課堂，此時(shí)如何確定H的相對(duì)位置？如何考慮其間應(yīng)該在何方向上形成H鍵？
多謝指教！謝謝！

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10樓2010-09-09 16:18:02

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