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zhaicatty木蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
【求助】ATK計(jì)算雙電極體系的總能量 已有1人參與
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聽(tīng)前輩說(shuō)在進(jìn)行雙電極系統(tǒng)的優(yōu)化前，可以先設(shè)定一系列分子到電極的距離d，計(jì)算一個(gè)能量－距離（E-d）曲線，得到對(duì)應(yīng)最低能量的距離作為分子到電極的平衡距離，再對(duì)這個(gè)距離的體系進(jìn)行優(yōu)化。 我試圖按照這樣的方法找到對(duì)應(yīng)最低能量的分子—電極距離，但是發(fā)現(xiàn)即使不改變分子—電極間距，保持所有的參數(shù)條件都不變，計(jì)算體系的能量，結(jié)果每次結(jié)果都不同，有的時(shí)候還相差挺大的。使得計(jì)算出來(lái)的每組E-d曲線都不同。不知道這是什么原因？ 菜鳥(niǎo)初學(xué)，請(qǐng)高手指教！ [ Last edited by zhaicatty on 2010-9-9 at 21:35 ] |
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zhaicatty(金幣+1):謝謝參與
zhaicatty(金幣+2):謝謝分享經(jīng)驗(yàn) 2010-09-10 22:56:16
zzy870720z(金幣+1):謝謝指教 2010-09-11 08:17:04
zhaicatty(金幣+1):謝謝參與
zhaicatty(金幣+2):謝謝分享經(jīng)驗(yàn) 2010-09-10 22:56:16
zzy870720z(金幣+1):謝謝指教 2010-09-11 08:17:04
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我經(jīng)常這樣處理一些問(wèn)題，但是你還是要仔細(xì)考慮電極與分子間距離d的問(wèn)題。 我覺(jué)得如果你不考慮電極與分子間的相互作用，這個(gè)問(wèn)題還是很簡(jiǎn)單的，就是將你的分子和電極做成ATK中的bulk（ATK計(jì)算bulk能量還是可以的），逐漸改變d計(jì)算能量，然后做E-d曲線就是了。也可以用別的軟件做，我一般使用VASP。 |
4樓2010-09-10 17:09:21
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