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zhaicatty木蟲(chóng) (小有名氣)
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[交流]
【求助】ATK計(jì)算雙電極體系的總能量 已有1人參與
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聽(tīng)前輩說(shuō)在進(jìn)行雙電極系統(tǒng)的優(yōu)化前,可以先設(shè)定一系列分子到電極的距離d,計(jì)算一個(gè)能量-距離(E-d)曲線,得到對(duì)應(yīng)最低能量的距離作為分子到電極的平衡距離,再對(duì)這個(gè)距離的體系進(jìn)行優(yōu)化。 我試圖按照這樣的方法找到對(duì)應(yīng)最低能量的分子—電極距離,但是發(fā)現(xiàn)即使不改變分子—電極間距,保持所有的參數(shù)條件都不變,計(jì)算體系的能量,結(jié)果每次結(jié)果都不同,有的時(shí)候還相差挺大的。使得計(jì)算出來(lái)的每組E-d曲線都不同。不知道這是什么原因? 菜鳥(niǎo)初學(xué),請(qǐng)高手指教! [ Last edited by zhaicatty on 2010-9-9 at 21:35 ] |

木蟲(chóng) (小有名氣)

金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
實(shí)習(xí)版主

木蟲(chóng) (小有名氣)

金蟲(chóng) (小有名氣)
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我經(jīng)常這樣處理一些問(wèn)題,但是你還是要仔細(xì)考慮電極與分子間距離d的問(wèn)題。 我覺(jué)得如果你不考慮電極與分子間的相互作用,這個(gè)問(wèn)題還是很簡(jiǎn)單的,就是將你的分子和電極做成ATK中的bulk(ATK計(jì)算bulk能量還是可以的),逐漸改變d計(jì)算能量,然后做E-d曲線就是了。也可以用別的軟件做,我一般使用VASP。 |
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