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piaoma木蟲(chóng) (小有名氣)
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【討論】如何否定某一復(fù)合物結(jié)構(gòu)的存在？
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各位，請(qǐng)教一個(gè)問(wèn)題。 有一依靠弱相互作用穩(wěn)定（范德華和靜電力）的復(fù)合物體系（有40個(gè)CNH的原子），有文獻(xiàn)通過(guò)b3lyp/6-31g++（d,p)優(yōu)化得到一穩(wěn)定結(jié)構(gòu)。但明顯該體系利用上述泛函優(yōu)化并不合適。現(xiàn)改用g09的b97d/tzvp優(yōu)化之（opt(maxcycle=1000,maxstep=1），但優(yōu)化無(wú)法正常結(jié)束；而且從其他一些角度來(lái)看，現(xiàn)懷疑該結(jié)構(gòu)能否穩(wěn)定存在。 請(qǐng)問(wèn)：我應(yīng)該如何說(shuō)明上述復(fù)合物其實(shí)是不能存在呢？ |
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2樓2010-09-12 14:10:40
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3樓2010-09-12 14:52:46
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感謝樓上二位的回答。 1）根據(jù)這個(gè)復(fù)合物體系結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，我采用的泛函肯定是比b3lyp合適，這一點(diǎn)，我和文獻(xiàn)作者討論過(guò)，他也是這樣認(rèn)為的 2）mp2的確比dft的方法要精確一些，但計(jì)算量實(shí)在太大，以我40個(gè)原子來(lái)計(jì)算，光優(yōu)化可能就得30多天（mp2/aug-cc-pvdz)(16核/16G),還不一定成功；如果采用一些小基組優(yōu)化，似乎又過(guò)于粗糙。 3）目前的實(shí)驗(yàn)還不能夠準(zhǔn)確的得到這些復(fù)合物結(jié)構(gòu)并予以測(cè)量。（大多是做IR,抽真空，引入待測(cè)分子，然后用氦氣或氬氣稀釋至不同濃度），所以最后的結(jié)構(gòu)到底如何，文獻(xiàn)作者也是根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)推測(cè)。 4）我想否定文獻(xiàn)作者所提出的部分復(fù)合物結(jié)構(gòu)，如何讓人信服？ |
4樓2010-09-12 22:39:56
qzhaosdu
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piaoma(金幣+10): 2010-09-13 12:22:09
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40個(gè)原子的體系，可以用密度擬合MP2，orca做這個(gè)是強(qiáng)項(xiàng)，而且有解析梯度。 有些特殊的體系，密度泛函并不準(zhǔn)。例如往氟乙烷的CF鍵中間插入一個(gè)氦原子，所有的密度泛函（GGA，Hybrid-GGA）都顯示這是個(gè)非常穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)，還被寫(xiě)進(jìn)了書(shū)。但并不被各種從頭算的結(jié)果支持。 但是如果體系含有3d過(guò)渡金屬，MP2也靠不住，甚至比雜化泛函還差。需要做ccsd(t)級(jí)別的計(jì)算。 復(fù)合物結(jié)構(gòu)是否存在，一般看經(jīng)過(guò)零點(diǎn)能矯正的穩(wěn)定化能。如果穩(wěn)定化能在1kcal/mol以下，即使處于超低溫環(huán)境也是難以存在的。 [ Last edited by beefly on 2010-9-13 at 02:27 ] |
6樓2010-09-13 02:25:11
7樓2010-09-13 09:19:14
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8樓2010-09-13 12:29:50
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