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paladinlee鐵桿木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助】dlpoly運(yùn)算error——392的解決方法 已有4人參與
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DL_POLY terminated due to error 392error - too many link cells requested 我用NPT系綜算出的問題，NVT算就沒問題。 config和field應(yīng)該沒問題，都是一樣的。 control文件如下： integrator leapfrog verlet temperature 300.00 pressure 0.0001 ensemble npt berendsen 1.0000 1.0000 steps 100000 equilibration 20000 multiple step 1 scale 10 print 10 stack 100 stats 10 trajectory 0 1000 0 rdf 10 timestep 0.0050 primary cutoff 5.000 cutoff 5.000 delr width 1.000 rvdw cutoff 5.000 no electrostatics shake tolerance 1.0E-5 quaternion tolerance 1.0E-5 ... 我看了手冊，說要改參數(shù)，具體怎么改？ 謝謝！ |
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5樓2015-03-10 16:57:11
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zh1987hs(金幣+4):謝謝 2010-10-13 19:00:14
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zh1987hs(金幣+4):謝謝 2010-10-13 19:00:14
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錯誤的原因是link cell數(shù)超過了系統(tǒng)默認(rèn)最大的link cell數(shù)，最簡單的辦法是加入no link 參數(shù)。 NVT下沒問題，NPT有問題：說明NPT下，體積增大，導(dǎo)致link cell 過大。首先，你的壓力設(shè)置為0.0001，相當(dāng)于0.1個大氣壓，是否有誤？ 你的初始盒子大小是否有誤？應(yīng)盡量接近實(shí)驗(yàn)值。 如果初始構(gòu)型太差的話，分子之間排斥占主導(dǎo)，也會引起體積過度變動。模擬前可先進(jìn)行opt 或0kmd 馳豫一下。 另外，控壓馳豫時(shí)間可以改小一點(diǎn)試試。 link cell 是一種加速模擬的方法，具體可以看Frenkel 和 smit 分子模擬那本書的附錄。 [ Last edited by 043114076 on 2010-10-13 at 18:50 ] |
3樓2010-10-13 18:47:06
paladinlee
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4樓2010-10-14 09:38:52
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