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[交流]
【求助】請教MS modeling 里的Display Style 已有4人參與
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| 各位，在MS modeling 里的Display Style 的Default，Incell，Orignal到底有什么區(qū)別，提交計(jì)算時(shí)用哪一種？另外計(jì)算前后不同序號(hào)的原子的位置會(huì)發(fā)生互換，大家又遇到過這種情況嗎？怎么解決呀？多謝！ |
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2樓2010-09-14 14:03:15
3樓2010-09-14 14:29:14
★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
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你的描述太拗口，還是不太明白你的問題，很抱歉。我們也是把CONTCAR轉(zhuǎn)成cif格式。或者你把兩個(gè)結(jié)構(gòu)文件發(fā)給我，看看能不能幫上。email: liuxingw3@163.com |
4樓2010-09-14 17:45:04
zzy870720z
榮譽(yù)版主 (文壇精英)
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- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
- 管轄: 分子模擬
5樓2010-09-14 19:39:42
6樓2010-09-15 08:50:14
★ ★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
aylayl08(金幣+3):感謝回復(fù) 2010-09-15 15:55:23
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
aylayl08(金幣+3):感謝回復(fù) 2010-09-15 15:55:23
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大體能明白你要表達(dá)的意思。對于一個(gè)有周期性邊界條件的slab模型，結(jié)構(gòu)優(yōu)化后，邊界的上的一個(gè)原子馳豫到下一周期，同樣它上一個(gè)周期中相應(yīng)的原子會(huì)有同樣的動(dòng)作，凈的結(jié)果是原子個(gè)數(shù)沒變，而優(yōu)化結(jié)構(gòu)坐標(biāo)的變化是肯定有的。體系的能量決定于體系的幾何結(jié)構(gòu)（坐標(biāo)），坐標(biāo)不同，原則上體系的能量會(huì)不同 |
7樓2010-09-15 10:03:18
8樓2010-09-15 10:16:10
★ ★ ★
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
aylayl08(金幣+2):感謝討論 2010-09-15 15:55:39
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
aylayl08(金幣+2):感謝討論 2010-09-15 15:55:39
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嗯,能量一不一樣要看相對與誰,我覺得結(jié)構(gòu)優(yōu)化后,原子坐標(biāo)變動(dòng)是很自然的事情,體系的能量必然是降低的,當(dāng)一個(gè)結(jié)構(gòu)優(yōu)化計(jì)算正常收斂,給出的結(jié)構(gòu)和對應(yīng)的能量應(yīng)該是可靠的. 至于原子為什么跑到下一周期,這大概涉及到這種模型方法的基本思想吧,剛接觸時(shí),我也想過沒想明白,現(xiàn)在也說不明白.但是,可以想象這個(gè)周期的原子走到下一周期,它的上一周期同樣位子的原子同樣的動(dòng)作補(bǔ)充到這個(gè)周期中,原子數(shù)不會(huì)變. |
9樓2010-09-15 10:52:39
10樓2010-09-15 11:57:41
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