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vasp001金蟲 (正式寫手)
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【求助】安裝Materials Studio 總是提示JRE 環(huán)境找不到，
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安裝Materials Studio 總是提示JRE 環(huán)境找不到，請問如何解決？ Last login: Wed Sep 15 21:03:11 2010 from 202.38.88.229 聯(lián)想公司贈送的深騰1800高性能機(jī)已基本安裝調(diào)試完畢，開始試運(yùn)行。 該機(jī)有64臺計(jì)算節(jié)點(diǎn)，每個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)為雙Intel E5410 CPU，4G內(nèi)存，通過千兆以太網(wǎng)互 聯(lián)，峰值計(jì)算能力4.77TFLOPS。 操作系統(tǒng)為CentOS 5.2，安裝有g(shù)cc 4.1.2, icc 10.1，i fort 10.1等編譯軟件，Intel MKL庫等。 安裝的軟件主要在目錄/opt下，相關(guān)的文檔也在里面。 使用方式與原有HP RX2600 集群基本相同。機(jī)器中開了2個(gè)作業(yè)調(diào)度隊(duì)列，分別是normal 和mpi隊(duì)列。normal隊(duì)列限制一個(gè)作業(yè)最多占用8個(gè)CPU，并限制在一臺機(jī)器中運(yùn)行， 這樣做是為了減少跨機(jī)器的通信以提高效率。mpi隊(duì)列限制一個(gè)作業(yè)最多占用64個(gè) CPU，可以運(yùn)行稍微大一些的MPI作業(yè)。 提交作業(yè)例子: 1. 提交一個(gè)占用8 CPU的./cpi例子作業(yè) bsub -n 8 -o cpi_8.out -e cpi_8.err mpijob ./cpi 2. 提交一個(gè)占用64 CPU的./cpi例子作業(yè) bsub -q mpi -n 64 -o cpi_64.out -e cpi_64.err mpijob ./cpi 3. 提交一個(gè)占用8 CPU的openMP作業(yè) bsub -a openmp -n 8 -o job.o -e job.e ./openmp_prog 注意： 現(xiàn)在所有機(jī)器共享一個(gè)磁盤陣列，所以I/O的性能很低（所有節(jié)點(diǎn)I/O帶寬1G），如果運(yùn) 算中需要用到臨時(shí)文件，可以使用各個(gè)節(jié)點(diǎn)的/local目錄（每個(gè)節(jié)點(diǎn)I/O帶寬接近1G， 這個(gè)目錄各個(gè)節(jié)點(diǎn)獨(dú)立，不共享）。 更新： 1. 安裝了Python2.5，在/opt/Python2.5下 2. 主節(jié)點(diǎn)上每用戶最多允許500個(gè)進(jìn)程，占用1G內(nèi)存 3. 修改成每個(gè)用戶最多占用128處理器 (2008.11.04 以前為200) Notice: Serial jobs ,please to use the " serial " queue : -q serial |
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