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vasp001金蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助】重金懸賞 計(jì)算軟件的幾個(gè)問題，懸賞150個(gè)金幣。
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1。對于VASP 軟件而言，計(jì)算使用的CPU 頻率，內(nèi)存，網(wǎng)絡(luò)速度（選用的網(wǎng)絡(luò)類型），硬盤轉(zhuǎn)速，那些體系對于計(jì)算的速度影響較大。 2。對于Dmol3 而言，計(jì)算使用的CPU 頻率，內(nèi)存，網(wǎng)絡(luò)速度（選用的網(wǎng)絡(luò)類型），硬盤轉(zhuǎn)速，那些體系對于計(jì)算的速度影響較大。 3。同樣，對于Tran sistea ，而言呢？ 4。 對于Gaussian呢？ 5。對于ATK 呢？ 6。對于ADF 呢 如果，大約想主要以VASP 計(jì)算為主，同時(shí)能夠兼顧常用的計(jì)算軟件？什么樣的配置不錯(cuò)。初步預(yù)算在50萬左右。 還請各位多加指導(dǎo)。關(guān)鍵，是VASP 和Dmol ，那些配置，如VASP Dmol3 等對CPU 主頻和二級緩存，以及內(nèi)存的依賴，什么樣的配置可以顯著提高計(jì)算速度？ 請大家重點(diǎn)討論這個(gè)。 [ Last edited by vasp001 on 2010-9-21 at 20:02 ] |
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zxzj05(金幣+1):謝謝回帖交流 2010-09-21 11:43:38
vasp001(金幣+5): 2010-09-21 20:00:43
vasp001(金幣+5): 2010-09-27 18:40:18
zxzj05(金幣+1):謝謝回帖交流 2010-09-21 11:43:38
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vasp001(金幣+5): 2010-09-27 18:40:18
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計(jì)算機(jī)性能符合木桶原理，所以哪個(gè)都不能差，哪個(gè)差，哪個(gè)就是瓶頸，別的再高都是白搭。 50萬的預(yù)算不多，建議先考慮高性能的CPU 配合穩(wěn)定的主板， 內(nèi)存看需要，不夠的時(shí)候，以后再逐步加上去 網(wǎng)絡(luò)速度（選用的網(wǎng)絡(luò)類型），硬盤（似乎對服務(wù)器不只是轉(zhuǎn)速決定的，要看硬盤的類型），這些預(yù)算還是先不要考慮了 |
7樓2010-09-21 11:30:51
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8樓2010-09-21 17:21:34
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vasp001(金幣+10): 2010-09-27 18:40:26
mazuju028(金幣+2):謝謝交流 2010-09-27 15:03:54
vasp001(金幣+10): 2010-09-27 18:40:26
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個(gè)人的使用經(jīng)驗(yàn)，vasp對于內(nèi)存和網(wǎng)絡(luò)速度要求很高。計(jì)算一個(gè)稍微大點(diǎn)的體系，或者計(jì)算精度稍微提高，vasp要求的內(nèi)存就會很大；而如果想要多個(gè)節(jié)點(diǎn)一起并行，網(wǎng)絡(luò)速度非常重要，否則多個(gè)節(jié)點(diǎn)還不如一個(gè)節(jié)點(diǎn)快。我們實(shí)驗(yàn)室目前內(nèi)存最大的節(jié)點(diǎn)有48G的，在計(jì)算表面體系和大分子的情況下仍然緊張；節(jié)點(diǎn)間采用千兆以太網(wǎng)不能滿足并行要求，配置了Infiniband設(shè)備才真正發(fā)揮vasp的并行效率。 以上兩個(gè)方面是發(fā)揮vasp速度的最重要環(huán)節(jié)，其它方面相對來說不敏感，當(dāng)然單個(gè)節(jié)點(diǎn)內(nèi)部cpu的頻率越快是越好的。 |
9樓2010-09-27 09:34:56
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10樓2011-05-08 17:53:54
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