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hxy366金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】弱問一下gaussian03輸出結(jié)果中這些縮寫的含義，謝謝！
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以下為一段輸出結(jié)果： NAtoms= 30 NActive= 30 NUniq= 30 SFac= 7.50D-01 NAtFMM= 80 NAOKFM=F Big=F One-electron integrals computed using PRISM. NBasis= 346 RedAO= T NBF= 346 NBsUse= 346 1.00D-06 NBFU= 346 Harris functional with IExCor= 402 diagonalized for initial guess. ExpMin= 1.61D-01 ExpMax= 4.17D+03 ExpMxC= 6.27D+02 IAcc=1 IRadAn= 1 AccDes= 1.00D-06 HarFok: IExCor= 402 AccDes= 1.00D-06 IRadAn= 1 IDoV=1 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000 其中的NAtoms，NActive，NUniq， SFac，NAtFMM，NAOKFM， NBasis， RedAO， NBF，NBsUse，NBFU，IExCor，AccDes， IRadAn， IDoV，ScaDFX是什么的縮寫？代表什么意思？謝謝各位！ |
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coolrainbow
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2樓2010-09-27 07:42:21
3樓2010-09-27 14:15:31
sobereva
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hxy366(金幣+10):果然是大牛��！ 2010-09-30 13:45:04
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有些直接靠變量名就能猜到，比如NAtoms（原子數(shù)）、NBasis（基函數(shù)數(shù)） 有些可以推測然后檢驗(yàn)，比如NUniq，從名字和它出現(xiàn)的位置，自然會聯(lián)想到the number of symmetry unique atoms，然后找個(gè)帶對稱性的體系一算就驗(yàn)證了此推測。 高斯有Programmer's Reference，若有電子版，打開此文檔把變量名放在里面搜索，也很可能直接就找到解釋。比如NBsUse，自然聯(lián)想到是指實(shí)際被使用了的基函數(shù)數(shù)目（剔除了線性相關(guān)基函數(shù)后的數(shù)目），但不太好驗(yàn)證，從Programmer's Reference里面一搜就得到了解釋，和推測得一樣：The number of linearly independent basis functions。再比如搜IRadAn也直接得到解釋：Usual integration grid selection parameter. 直接搜索源代碼中相應(yīng)變量名，有時(shí)直接就能從注釋中找到其含義。 如果上述辦法都不奏效，就得讀源代碼。很多變量只是給開發(fā)者看的，對用戶的使用起不到任何幫助，沒必要追究。 |
4樓2010-09-27 20:41:53
5樓2010-09-27 21:15:19
coolrainbow
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hxy366(金幣+8):謝謝！ 2010-09-30 14:16:11
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Gaussian的輸出文件應(yīng)該是所有量化軟件中廢話最多了 既然sobereva大神說了，我也解釋幾句。這些變量好多在Gaussian源碼里都是全局變量，像natoms屬于common/Mol/，也有的是局部變量，事實(shí)上，很多內(nèi)容對于用戶根本沒啥用。 讀gaussian的源碼是件很痛苦的事，他的代碼和現(xiàn)代的一些開源量化軟件如nwchem，dolton有很大不同，由于歷史原因，gaussian的某些數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)似乎比較老，很多東西都是存儲在靜態(tài)數(shù)組里的，比如gaussian中有一個(gè)寫wfn的subroutine，最后寫SCF能量和viral值時(shí)候，語句是： Write(IUnit,1090) Gen(32), Gen(1) 誰知道Gen(32)是什么玩意。從文檔里才知道，原來gaussian有個(gè)Gen(1000)的全局?jǐn)?shù)組，里面從Gen(1)-Gen(47)儲存的都是計(jì)算的全局變量： 1 viral quotein 2-4 component of applied electriic field, if any 5 2e SCF energy .... 32 SCF energy 當(dāng)然，SCF的subroutine內(nèi)部是用TEnrgy來存儲SCF能量，最后才轉(zhuǎn)存到Gen(32)的。其他的軟件，如NWCHEM，似乎沒有這種結(jié)構(gòu)。因此，讀源碼時(shí)一定要注意這點(diǎn) |
6樓2010-09-27 21:37:45
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