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nkleof銀蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助】vasp的計算時間含義
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優(yōu)化一個結(jié)構(gòu)，發(fā)現(xiàn)每個離子步的計算有兩個計算時間數(shù)據(jù)，一個是cpu time，一個是real time，而且兩個數(shù)據(jù)有時候差別較大。 我的理解是cpu time是vasp100%利用cpu運(yùn)算的時間，real time是整個作業(yè)所耗的時間，包含數(shù)據(jù)讀取寫入或者并行節(jié)點(diǎn)間的等待時間等等。cpu time和real time的比值表示并行計算效率。 那么從下面的優(yōu)化時間數(shù)據(jù)來看，對于同一個體系結(jié)構(gòu)，進(jìn)行優(yōu)化的中間各步的計算效率差別會比較大，這是為什么？各步的內(nèi)存占用應(yīng)該是差不多的啊，為什么有的效率高，有的效率低？影響計算效率的關(guān)鍵因素是什么呢？ LOOP+: cpu time31435.63: real time49241.05 LOOP+: cpu time17906.79: real time18247.08 LOOP+: cpu time17024.20: real time27126.50 ~~~~~~ ~~~~~~ LOOP+: cpu time15354.10: real time18461.83 LOOP+: cpu time17565.64: real time19907.05 LOOP+: cpu time15009.27: real time15473.92 LOOP+: cpu time16362.70: real time27032.38 LOOP+: cpu time20439.95: real time24267.30 LOOP+: cpu time 7985.91: real time 8122.31 ~~~~~ ~~~~~~ LOOP+: cpu time16603.43: real time16930.20 LOOP+: cpu time14694.33: real time14986.32 LOOP+: cpu time14642.99: real time35428.18 ~~~~~~ ~~~~~~ LOOP+: cpu time14783.55: real time15176.58 [ Last edited by mazuju028 on 2010-9-27 at 15:05 ] |
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aylayl08(金幣-1):禁止無意義回帖獲取金幣，扣回所得 2010-09-29 15:20:05
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2樓2010-09-28 10:19:50
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aylayl08(金幣+2):感謝討論 2010-09-29 19:10:14
aylayl08(金幣+2):感謝討論 2010-09-29 19:10:14
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應(yīng)該沒問題，但是注意你處理的能帶數(shù)目盡可能的是你node的倍數(shù)。 說實(shí)話，我以前是用pwscf的，pwscf的并行方式好像和vasp的不太一樣，pwscf要求k點(diǎn)的設(shè)置是node的倍數(shù)，因?yàn)閜wscf是按K點(diǎn)的個數(shù)并行的。所以這個問題我也不是很清楚。不過我確實(shí)沒遇到過你說的那種遠(yuǎn)大于的情況，一般real time會大一點(diǎn)，但是不會大太多，我是沒遇到過超過10%的情況。也有可能是我一般算的體系都比較小。 [ Last edited by dxcharlary on 2010-9-29 at 19:09 ] |
8樓2010-09-29 19:03:45
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10樓2010-10-05 09:58:05
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