Yolanda7

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[交流] 【求助】cif導(dǎo)入Materials studio后改變已有2人參與

大家好，我導(dǎo)入一個(gè)ICSD #33243 關(guān)于BiVO4的cif文件到Materials Studio,gamma角卻由90.387°變?yōu)?0°，對(duì)稱(chēng)性也發(fā)生變化。而且手動(dòng)改不過(guò)來(lái)。

而且，由Materials Studio導(dǎo)出的cif文件中的對(duì)稱(chēng)性、gamma角度都發(fā)生了相應(yīng)的改變。

問(wèn)題二：為什么Materials studio導(dǎo)出的cif文件信息比ICSD的要少。能否設(shè)置使其導(dǎo)出更多的cif信息？

問(wèn)題三：為什么不同軟件得到的cif文件信息不一樣？我看到有的cif文件包含衍射、氫鍵等信息，而ICSD，Materials Studio導(dǎo)出的cif文件卻沒(méi)有？

有沒(méi)有大俠解釋下。謝謝。

這是ICSD的cif文件
data_33243-ICSD
...........
_cell_length_a                   5.197
_cell_length_b                   5.096
_cell_length_c                   11.702
_cell_angle_alpha                90.
_cell_angle_beta                90.
_cell_angle_gamma                90.4
_cell_volume                      309.91
_cell_formula_units_Z             4
_symmetry_space_group_name_H-M    'I 1 1 2/b'
_symmetry_Int_Tables_number       15
_refine_ls_R_factor_all          .058
loop_
_symmetry_equiv_pos_site_id
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  1 '-x, -y+.5, z'
  2 'x, y+.5, -z'
  3 '-x, -y, -z'
  4 'x, y, z'
  5 '-x+.5, -y, z+.5'
  6 'x+.5, y, -z+.5'
  7 '-x+.5, -y+.5, -z+.5'
  8 'x+.5, y+.5, z+.5'
loop_
_atom_type_symbol
_atom_type_oxidation_number
Bi3+ 3
O2- -2
V5+ 5
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_symmetry_multiplicity
_atom_site_Wyckoff_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_occupancy
_atom_site_attached_hydrogens
_atom_site_B_iso_or_equiv
Bi1 Bi3+ 4 e 0 0.25 0.6337(1) 1. 0 -.064
V1 V5+ 4 e 0 0.25 0.1352(5) 1. 0 0.392
O1 O2- 8 f 0.149(3) 0.506(8) 0.210(2) 1. 0 0.43
O2 O2- 8 f 0.258(3) 0.379(8) 0.451(2) 1. 0 0.566

#End of data_33243-ICSD

這是由Materials Studio導(dǎo)出的cif文件

data_BiVO4-3
_audit_creation_date             2010-10-04
_audit_creation_method          'Materials Studio'
_symmetry_space_group_name_H-M 'C2/C'
_symmetry_Int_Tables_number    15
_symmetry_cell_setting          monoclinic
loop_
_symmetry_equiv_pos_as_xyz
  x,y,z
  -x,y,-z+1/2
  -x,-y,-z
  x,-y,z+1/2
  x+1/2,y+1/2,z
  -x+1/2,y+1/2,-z+1/2
  -x+1/2,-y+1/2,-z
  x+1/2,-y+1/2,z+1/2
_cell_length_a                   5.1970
_cell_length_b                   5.0960
_cell_length_c                   11.7020
_cell_angle_alpha                90.0000
_cell_angle_beta                90.0000
_cell_angle_gamma                90.0000
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_adp_type
_atom_site_occupancy
Bi1 Bi 0.00000 0.25000 0.63370  -0.00081  Uiso 1.00
V1    V    0.00000 0.25000 0.13520 0.00496  Uiso 1.00
O1    O    0.14900 0.50600 0.21000 0.00545  Uiso 1.00
O2    O    0.25800 0.37900 0.45100 0.00717  Uiso 1.00

[ Last edited by Yolanda7 on 2010-9-29 at 11:37 ]

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1樓 2010-09-29 11:22:35

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lfc85

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為什么用Materials Studio導(dǎo)出cif文件呢？

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2樓2010-09-29 16:02:00

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Yolanda7

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引用回帖:

Originally posted by lfc85 at 2010-09-29 16:02:00:
為什么用Materials Studio導(dǎo)出cif文件呢？

只是初學(xué)Materials Studio,剛剛接觸cif文件，弄著玩，卻發(fā)現(xiàn)了上述不同。。。呵呵，期待大俠解釋下。。。

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喜洋洋~

3樓2010-09-29 16:27:36

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xi2004

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的確會(huì)。
可以點(diǎn)build crystal, 選擇正確的空間群

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xi2004-emuch@163.com

4樓2010-09-29 16:49:33

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Yolanda7

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引用回帖:

Originally posted by xi2004 at 2010-09-29 16:49:33:
的確會(huì)。
可以點(diǎn)build crystal, 選擇正確的空間群

請(qǐng)問(wèn)，您知道unique axis是什么意思嗎？

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喜洋洋~

5樓2010-09-29 22:14:52

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orpheus

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小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

請(qǐng)教如何導(dǎo)入CIF文件呀？

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simple person, simple life.

6樓2015-05-15 17:38:45

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PY-Hzb

禁蟲(chóng)

★
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

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7樓2021-05-04 00:12:30

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