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gql119銅蟲 (小有名氣)
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【討論】autodock運(yùn)行時(shí)間過長 已有4人參與
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| 大家好：我是剛剛接觸autodock, 按網(wǎng)上教程來一步步做的，但當(dāng)做到run-autodock這步時(shí)，運(yùn)行時(shí)間達(dá)12個(gè)小時(shí)了，但還是沒運(yùn)行完，這是怎么回事兒呢，屬于正常情況嗎？難道說跟參數(shù)設(shè)置有關(guān)嗎？ |
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3樓2010-10-15 15:09:01
2樓2010-10-15 11:18:10
tjegg
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4樓2010-10-15 17:14:15
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5樓2010-10-15 21:16:15
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6樓2010-10-15 21:17:25
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7樓2010-10-15 21:18:41
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由于運(yùn)行過長，當(dāng)打開它生成的文件時(shí)里面出現(xiàn)的這樣的一句話： ATOM 1 1 -7.622 -3.553 19.339 +0.00 +0.00 -0.345 ATOM 2 1 -8.572 -3.544 19.403 +0.00 +0.00 +0.219 ATOM 3 1 -7.201 -2.404 18.787 +0.00 +0.00 +0.156 ATOM 4 1 -8.099 -1.335 18.555 +0.00 +0.00 +0.077 ATOM 5 1 -7.529 -0.163 17.975 +0.00 +0.00 +0.137 ATOM 6 1 -9.488 -1.051 18.744 +0.00 +0.00 +0.126 ATOM 7 1 -8.561 0.757 17.842 +0.00 +0.00 -0.285 ATOM 8 1 -6.193 -0.042 17.638 +0.00 +0.00 -0.337 ATOM 9 1 -9.729 0.201 18.311 +0.00 +0.00 -0.309 ATOM 10 1 -8.541 1.678 17.487 +0.00 +0.00 +0.188 ATOM 11 1 -10.637 0.665 18.328 +0.00 +0.00 +0.186 ATOM 12 1 -5.433 -1.113 17.893 +0.00 +0.00 +0.184 ATOM 13 1 -5.812 0.808 17.222 +0.00 +0.00 +0.168 ATOM 14 1 -5.893 -2.288 18.459 +0.00 +0.00 -0.332 ATOM 15 1 -5.252 -3.063 18.627 +0.00 +0.00 +0.168 eval.cc: ERROR! energy is infinite! 而且循環(huán)的error，內(nèi)容都跟上面的相同，到底是哪里出問題了呢？？？  |
8樓2010-10-15 21:23:40
tjegg
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10樓2010-10-16 13:55:42
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