 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1446 | 回復(fù): 3 | |||
hopebiolqdhb金蟲 (著名寫手)
|
[交流]
【轉(zhuǎn)帖】看到個有趣的帖子轉(zhuǎn)過來了 已有3人參與
|
|
基因的角度看細菌分類 （一）：細菌是進化的，也是可以分類的 1875年，F(xiàn)erdinand J.Cohn最初創(chuàng)立了細菌學(xué)的時候，他就意識到，細菌跟動、植物一樣，是可以進行分類的。其時，達爾文發(fā)表了《物種起源》，進化論的思想已初入人心。而進化論的主題思想有兩個，第一，物種是可變的；第二，生物是進化的。那么，細菌作為一種生物物種的類型，是如何進化的呢？與動、植物所不同的是，細菌結(jié)構(gòu)在結(jié)構(gòu)微小，不可能像動、植物分類一樣，通過挖掘遠古時代活化石的方式去研究細菌的進化途徑。因此，該如何對細菌進行科學(xué)的分類，卻始終微生物學(xué)家所面臨的一大難題。 20世紀(jì)初，在美國細菌學(xué)家David Hendricks Bergey的推動下，成立了一個組織委員會，以制定一個針對所有已知細菌的分類計劃。并且，通過這個已有的分類計劃，可以根據(jù)不同的標(biāo)準(zhǔn)，如革蘭氏染色、形態(tài)、菌落外、以及生化反應(yīng)等，對所有的細菌進行鑒定。由此可見，最初的細菌分類主要是根據(jù)細菌的相似程度進行分類描述方法，與生物進化無關(guān)。但不可否認，Bergey所倡導(dǎo)的分類方法，為細菌學(xué)的發(fā)展作出了巨大貢獻。自1923年首次出版《伯杰氏系統(tǒng)細菌學(xué)手冊》后，先后于1925、1930、1934、1939、1948、1957、1974出版了第2至第8版。 20世紀(jì)60年代開始，分子遺傳學(xué)和分子生物學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展使細菌分類學(xué)進入了分子生物學(xué)時代。60年代末，Carl.R.Woese開始采用遺傳物質(zhì)的寡核苷酸編目法對生物進行分類，他通過比較各類生物細胞的核糖體RNA特征序列，認為16S rRNA是最合適的生化進化時鐘。Woese通過基因序列分析方法，發(fā)現(xiàn)第三生命形式——古菌。通過對古菌的研究，Woese進一步建立了三域生命學(xué)說，并首次根據(jù)進化關(guān)系建立了包括細菌在內(nèi)的所有細胞生物的系統(tǒng)發(fā)育樹。 Woese的研究和發(fā)現(xiàn)，無疑具有劃時代意義。首先，古菌作為能夠在極端的環(huán)境中生存的原核微生物，代表著生命對環(huán)境適應(yīng)能力的極限，是一種不可估量的資源財富。設(shè)想一下，將來有一天，我們需要征服火星，讓火星變成一個適合人類生存的星球，那么，這些能夠在極度高溫、高寒、高酸性環(huán)境中生存，并能夠利用甲烷等其他氣體營自生生活的古菌，絕對會是火星開發(fā)的發(fā)行軍。再設(shè)想一下，如果找一到了這樣一種古菌，不僅能耐受極度高溫、高寒，并能夠利用甲烷等其他氣體作為營養(yǎng)物質(zhì)，營自養(yǎng)生活釋放氧氣，那么，人類征服宇宙，將不再是一個夢想。因此，古菌自發(fā)現(xiàn)之初，就備受觀注，原核生物學(xué)也成為當(dāng)成科學(xué)研究中最熱門的話題。其次，Woese及后來的科學(xué)家通過研究發(fā)現(xiàn)，盡管古菌在細胞形態(tài)、大小及基因組結(jié)構(gòu)方面與細菌相似，但在基因的相似性和系統(tǒng)發(fā)育學(xué)上，卻獨立成支，而且在親緣關(guān)系上，古菌與真核生物更為密切，與細菌反而更疏遠。Woese在通過對古菌、細菌、真核生物基因序列比較的基礎(chǔ)上，建立了三域生命學(xué)說，即當(dāng)前的生命包括：細菌域、古菌域、真核生物域。后來，又有人將真核生物域劃分為原生生物界、真菌界、植物界、動物界，與古菌界、真核界并列形成三域六界的生物分類體系。通過生命進化之樹，生命不再獨立存在，生命不再孤獨，而是通過系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，按域、門、綱、目、科、屬、種從上到下的等級分類方法，形成了一個系統(tǒng)的、有機的、有聯(lián)系的整體。 1994年，《伯杰氏系統(tǒng)細菌學(xué)手冊》出版第9版。與前8版所不同的是，第9版在描述細菌表觀特征、生物化學(xué)、數(shù)值分類的基礎(chǔ)上，特別強調(diào)了DNA相關(guān)性分析，以及16S rRNA寡核苷酸序列分析在生物種群間的親緣關(guān)系研究中的應(yīng)用，細菌分類的研究開始從表觀生化向系統(tǒng)發(fā)育進化發(fā)展。 隨著酶鏈聚合反應(yīng)（PCR）技術(shù)、基因測序技術(shù)、遠程通訊技術(shù)及計算機技術(shù)的開發(fā)，人類進入到一個全新的基因時代。2000年，人類基因組DNA序列圖譜完成后，科學(xué)家又開始著手繪制與人類密切的相關(guān)致病菌的基因圖譜。在GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫中，與細菌相關(guān)的核酸序列信息呈爆炸式增長。微生物學(xué)家只需要對待鑒定的細菌進行測序，就可以坐在家里，通過遠程計算機系統(tǒng)，獲取最近細菌分類及核酸序列信息，構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進化樹，找到待鑒定細菌的系統(tǒng)發(fā)育進化的位置。 基因的視角看細菌之二：問題一籮筐 進化論的思想告訴我們：第一，物種是可變的；第二，生物是由低等向高等的次序進化的。但隨著生物技術(shù)的發(fā)展，我們不妨加上第三點，物種是可人為創(chuàng)造的。設(shè)想了一系列關(guān)于生物分類相關(guān)的問題，不一定有標(biāo)準(zhǔn)答案，也不一定與細菌有關(guān)，但仔細思想這些問題，或許有助于我們更好地了解細菌的分類。如果有人有興趣回答這些問題，請先不查閱資料回答。 1、狼與狗是兩個不同的物種，狼與狗雜交，叫狼狗。請問狼狗是狗嗎？即狼狗與狗為同一個種嗎？ 2、既然狼與狗是兩個不同的物種，那么狼與狗雜交，可不可以是狼？可不可以叫狗狼？ 3、獅與虎是兩個不同的物種，雄獅與雌虎交配的產(chǎn)物叫獅虎；雄虎與雌獅交配的產(chǎn)物叫虎獅。是不是意味著，獅虎是虎，虎獅是獅？ 4、雞與鴨交配，能得到受精卵的雞蛋嗎？如果可以，公雞與母鴨交配孵出來的“小鳥”，是不是可以叫做雞鴨？公鴨與母雞交配孵出來的“小鳥”，是不是可以叫做鴨雞？ 5、如果雄獅與雌虎交配的產(chǎn)物獅虎，既不屬于獅，也不屬于虎，而是一個新物種；雄虎與雌獅交配的產(chǎn)物虎獅，既不屬于虎，也不屬于獅，而是一個新物種；那獅虎與虎獅呢？是一個物種還是兩個物種？兩個相同的物種交配后，可以得到兩個以上的不同物種嗎？ 6、人與猿的全基因序列相似度達99%以上，是不是意味著人與猿在基因的角度上，是同一個物種？ 7、人是古猿經(jīng)過漫長的歷史過程，經(jīng)由類人猿演化而來的。請問從物種的角度上說，類人猿與古猿是同一個物種嗎？人、古猿、類人猿總共包含多少個不同的物種。 8、如果人、猿、與類人猿的全基因序列相似度均在99%以上，我們可不可以根據(jù)基因的相似度，把人、猿、與類人猿定義為同一個種，并設(shè)立為不同的亞種？ 9、盡管人由古猿經(jīng)過一個漫長的歷史過程中進化而來的，那么在地球的某個時期，會不會出現(xiàn)人、古猿、類人猿同時并存的情況？ 10、已知菌A是由菌B經(jīng)由菌C進化而來，有不有可能在某一年的某一天，同時分離到菌A、菌B、菌C三種細菌？ 11、發(fā)現(xiàn)經(jīng)菌A、菌B、菌C三種新細菌。經(jīng)測序，菌A、菌B、菌C全基因序列相似度均在99%以上，且經(jīng)過他資料，可推算，菌A是由菌B經(jīng)由菌C進化而來。但形態(tài)特型、致病能力具有典型的差異，且菌A的致病能力特別強，菌C致病能力相對較弱，分布范圍最廣泛。如果把菌A、菌B、菌C分類為同一個種，那我們是應(yīng)該選取致病能力最強的菌A選為模式菌種，還是應(yīng)該把分布范圍最廣的菌C選為模式菌種。 12、盡管菌A、菌B、菌C全基因序列相似度均在99%以上，但為了特別區(qū)分菌A，可不可以把致病能力最強、臨床意義最大的菌A單獨定義為一個種，菌B、菌C定義為另一種。 13、菌A、菌B、菌C是否有可能被定義為三個不同的菌種? 14、菌A、菌B、菌C是否有可能被定義為三個不同的菌屬? 15、你研究得最多、且最熟悉的細菌是什么？請問你知道研究得最多、且最熟悉的這個細菌屬于哪個域、哪個門、哪個綱、哪個科嗎？ 16、我們都知道，人是高等生物，那細菌呢？哪些細菌屬于高等細菌的范疇？ 17、請對比人類等高等生物與低等生物的特點，在自養(yǎng)與異養(yǎng)的角度上，推斷高等細菌與低等細菌的特點？ 18、請根據(jù)地球形成初期的氣候特征，推斷低等細菌的特點？ 19、大腸埃希氏菌是高等細菌嗎？為什么？ 20、嗜熱脂肪芽胞桿菌與大腸埃希氏菌相比，是高等生物嗎？為什么？ 21、你所知道的沙門菌屬有多少個種？請隨便列舉三個以上的沙門氏種。 22、歐洲人、亞洲人、非洲人、美洲人，可以定義為不同的物種嗎？為什么在布魯氏菌屬中，明明16S rRNA相似度為100%，卻根據(jù)不同的分離來源，分為羊布魯氏菌、牛布魯氏菌等不同的菌種？這種命名方式科學(xué)嗎？ 23、有一株低致病性的大腸埃希氏菌，送到外太空中，傳代1000次，回到地球后，其毒力增強百萬倍，并能穩(wěn)定遺傳，那么，從太空返回的“大腸埃希氏菌”還是大腸埃希氏菌嗎？可不可以認為是新物種？ 話題很新穎，轉(zhuǎn)來 轉(zhuǎn)自：丁香園 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
【考研調(diào)劑】化學(xué)專業(yè) 281分，一志愿四川大學(xué)，誠心求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
317求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
0817 化學(xué)工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿福大288有機化學(xué)，求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085600材料與化工求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
085600材料與化工調(diào)劑 324分
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
294求調(diào)劑材料與化工專碩
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
一志愿南昌大學(xué)，327分，材料與化工085600
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 各種速成英語（800個有趣句子+27天達到跟美國人交流+15天xxx）【轉(zhuǎn)載】
已經(jīng)有256人回復(fù)
- （轉(zhuǎn)載）手機貼膜傷視力
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 一個有趣的數(shù)學(xué)問題：我的朋友有多大概率來訪問我
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 有趣的貼子：心態(tài)100分
已經(jīng)有16人回復(fù)
- 【交流】轉(zhuǎn)的帖子，想求證一下在美國的蟲友是不是這樣？
已經(jīng)有17人回復(fù)
- 【轉(zhuǎn)帖】有趣的議論—彭思龍的博客—信息科學(xué)缺少類似數(shù)學(xué)的故事
已經(jīng)有14人回復(fù)
- 看到一個有意思的帖子
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 聯(lián)陪之后做博后的問題
已經(jīng)有26人回復(fù)
2樓2010-10-26 16:04:52
xp198766
鐵桿木蟲 (著名寫手)
小木蟲職業(yè)打醬油滴~~！
- MicEPI: 2
- 應(yīng)助: 5 (幼兒園)
- 金幣: 6525.1
- 散金: 262
- 紅花: 25
- 帖子: 2193
- 在線: 554小時
- 蟲號: 1046859
- 注冊: 2010-06-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 環(huán)境微生物學(xué)
3樓2010-10-26 16:12:02
 |
4樓2015-03-17 14:08:52
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 hopebiolqdhb 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0817 化學(xué)工程 299分求調(diào)劑 有科研經(jīng)歷 有二區(qū)文章 +10 | rare12345 2026-03-18 | 10/500 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工求調(diào)劑 +6 | 緒幸與子 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | ydfyh 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名 +4 | 脫穎而出 2026-03-16 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +8 | 妮妮ninicgb 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 司空. 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷 +3 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +6 | 26研0 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | △小透明* 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +6 | 困于星晨 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[基金申請]
今年的國基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | Yanyali 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 大米飯！ 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7 | 膩膩gk 2026-03-14 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 26考研一志愿中國石油大學(xué)(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +3 | 是Lupa啊 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 152697 2026-03-12 | 4/200 |
|