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relonfbq金蟲 (正式寫手)
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[交流]
【討論】lammps調(diào)溫問題
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我用下面命令標定了初始速度，然后run了幾萬步，發(fā)現(xiàn)其溫度壓力體積等許多參數(shù)都沒有變化？為什么在許多模擬中還要加入fix nvt／npt 或者temp／berendsen等調(diào)節(jié)溫度的命令呢？ 而且我加入fix nvt命令后，體系的溫度壓力等參數(shù)反而不穩(wěn)定了（當然我調(diào)節(jié)的也是300k到300k），這兩個問題總是想不明白，希望高人指點！ velocity all create 300 102486 mom yes rot yes dist gaussian run 80000 |
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老虎大王
木蟲 (著名寫手)
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2樓2010-10-28 08:24:38
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ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-11-09 12:58:17
relonfbq(金幣+10): 2011-04-17 15:05:33
ghcacj(金幣+4):謝謝 2010-11-09 12:58:17
relonfbq(金幣+10): 2011-04-17 15:05:33
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我假設(shè)你說的參數(shù)沒有變化時一個系綜都沒用（no fix npt/nvt/nve/nph...)， 這是再正確不過了，因為你的運動沒有時間積分，哪會有變化呢？加上系綜后溫度，體積波動是很正常的，取決于你的初始結(jié)構(gòu)和勢函數(shù)。如果你用了nve系綜還是參數(shù)沒有變化，那應(yīng)該就是你的初始結(jié)構(gòu)很好，勢函數(shù)準確。 如果是前者，你需要更好的了解分子動力學的基本原理。找本書看看吧，壇子里有很多帖子推薦了書。 |
3樓2010-11-08 23:55:48
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