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y851012172金蟲(chóng) (正式寫手)
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SCORPIO (Structure/Calorimetry of Reported Interactions Online) (29) is very similar in concept to the PDBcal database, although slightly more limited in scope with around 30 different proteins and more than 250 distinct protein–small molecule complexes. The small molecules comprise both natural ligands and synthetic compounds. As observed in the PDBcal database, only a small percentage of entries (15%) include measurements of the binding heat capacity. As the authors state, this shortfall is understandable given the extra effort required for such measurements, but regrettable because this parameter is strongly correlated to the extent and nature of binding interfaces and is thus a rich source of information. It can only be encouraged that future experimenters consider performing such measure- ments wherever possible. The authors have presented an extensive statistical analysis of the curated structure–ITC data. 前輩幫忙，謝謝！ |
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木蟲(chóng) (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
y851012172(金幣+2, 翻譯EPI+1): 2010-11-05 12:03:26
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SCORPIO（量熱結(jié)構(gòu)在線交互報(bào)道）雖然略微限制于大約30種不同的蛋白質(zhì)和250多個(gè)小分子特異混合蛋白，但與PDBcal數(shù)據(jù)庫(kù)在概念上非常相似。小分子由自然配體合成化合物組成。正如在PDBcal數(shù)據(jù)庫(kù)中觀察的那樣，只有一小部分項(xiàng)目（15％）包括對(duì)結(jié)合熱容量的測(cè)量。如作者所述，這需要額外的努力來(lái)測(cè)量，這種不足是可以接受的，但遺憾的是，這個(gè)參數(shù)與綁定接口的性質(zhì)和內(nèi)容密切相關(guān)，所以它是一個(gè)豐富信息的來(lái)源，只能鼓勵(lì)以后的實(shí)驗(yàn)者們盡可能的考慮進(jìn)行這種測(cè)量。作者提出了關(guān)于策劃結(jié)構(gòu)的廣泛數(shù)據(jù)分析———ITC數(shù)據(jù)。 （希望能對(duì)i你有所幫助）  |
2樓2010-11-05 11:29:16
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