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【求助】關(guān)于加H問(wèn)題 已有2人參與
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我在XP命令后 N原子加H 使用命令HADD 精修過(guò)后,發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)H的位置發(fā)生變化, 我用Diamond分別打開(kāi).ins .res和cif文件 發(fā)現(xiàn)分子間距離不一樣,相差較大,請(qǐng)問(wèn)這是什么原因? 精修過(guò)后和之前的H原子位置為什么發(fā)生變化? 謝謝!! |
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
鐵桿木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
| 主體結(jié)構(gòu)找完之后,先在ins文件里加入anis然后找氫。比較確定H位置的就用HADD命令。不確定的,就做幾次XL指認(rèn)N原子旁邊合適的Q峰為H(用bang命令看看鍵長(zhǎng)),這就是差值傅里葉找氫。因?yàn)閄L就是對(duì)結(jié)構(gòu)模型進(jìn)行差值傅里葉合成計(jì)算和最小二乘法精修的。 |
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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先根據(jù)鍵長(zhǎng)看看,那個(gè)N的序號(hào)幾,假如是N1 那你就在XP里輸入 bang N1 看看與N1相連的Q峰有沒(méi)有1.01A;左右的,有的話就差不多這個(gè)Q峰就是那個(gè)氫了,下面是一個(gè)鍵長(zhǎng)數(shù)據(jù)網(wǎng)站 http://www.wiredchemist.com/chem ... ergies_lengths.html 如果不行修改INS文件的PLAN 默認(rèn)是20 你把它改大,有可能那個(gè)Q峰太弱沒(méi)有出來(lái)。希望對(duì)你有幫助,如果還出不來(lái)那我也不知道咋弄了······ |
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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