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yashumimi銀蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】二維材料k點(diǎn)的設(shè)置 已有1人參與
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今天在算k點(diǎn)不同對transiesta計(jì)算結(jié)果的影響 k點(diǎn)設(shè)置為 1 0 0 0 1 0 0 0 i 其中i為變量 我將其設(shè)為2－20 因?yàn)殚_始用1算了 出錯(cuò) 是個(gè)二維的結(jié)構(gòu) x方向有一定的寬度 沒有周期性 加了真空層 y方向不變 z方向具有周期性 請問k點(diǎn)應(yīng)該怎么設(shè)置才合理呢？ 另外我更改k點(diǎn)后用tbtrans計(jì)算了I－V 同樣的操作 兩次 電流數(shù)量級有小幅度變化 趨勢變化規(guī)律也不一樣 這說明計(jì)算的結(jié)果不穩(wěn)定么？ |
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cenwanglai(金幣+3):謝謝廣平兄答復(fù)！ 2010-11-09 20:29:56
yashumimi(金幣+5):謝謝 2010-11-22 18:05:16
zzy870720z(金幣+3):謝謝zhang兄指教 2010-11-22 18:39:08
cenwanglai(金幣+3):謝謝廣平兄答復(fù)！ 2010-11-09 20:29:56
yashumimi(金幣+5):謝謝 2010-11-22 18:05:16
zzy870720z(金幣+3):謝謝zhang兄指教 2010-11-22 18:39:08
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對于scattering region一般是通過優(yōu)化得到中間結(jié)構(gòu)的。但是一旦做輸運(yùn)計(jì)算的時(shí)候，就不在考慮偏壓下的幾何結(jié)構(gòu)變化了。因?yàn)檫@個(gè)問題Transiesta是處理不了的。再說即使處理得了，這個(gè)時(shí)間也是負(fù)擔(dān)不起的。所以這個(gè)地方就有一個(gè)近似了。至于transiesta計(jì)算中輸出的力，已經(jīng)不再具有參考價(jià)值。不過聽說atk-2010.8可以在偏壓下進(jìn)行幾何結(jié)構(gòu)的優(yōu)化。具體的執(zhí)行方法我不是很清楚，但是明確的告訴你，transiesta不能勝任這個(gè)工作。 所以在做輸運(yùn)的時(shí)候，要將MD.NumCGsteps 設(shè)置為0，也就是說所有的關(guān)于MD的選項(xiàng)不再使用了。 關(guān)于這個(gè)你可以到siesta自帶的\Tests\transiesta目錄下，查看一下所有的散射區(qū)輸運(yùn)計(jì)算的輸入文件都是這樣設(shè)置的。 關(guān)于這個(gè)我就知道這么寫，如果有疑問，可以到siesta的mail_list上提問。 |
11樓2010-11-09 20:15:29
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2樓2010-11-05 22:37:18
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yashumimi(金幣+1):謝謝參與
mazuju028(金幣+2):很詳細(xì)。 2010-11-09 17:28:22
yashumimi(金幣+1):謝謝參與
mazuju028(金幣+2):很詳細(xì)。 2010-11-09 17:28:22
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你把你的輸入文件貼出來，高手可以用你的輸入文件具體查看一下，有時(shí)候你只是這么一說很難排查。我也想知道這個(gè)問題的答案。 我一直感覺對于碳納米管這種一維體系，k點(diǎn)設(shè)置如下就行： %block kgrid_Monkhorst_Pack 1 0 0 0.0 0 1 0 0.0 0 0 6 0.0 %endblock kgrid_Monkhorst_Pack 其中第一二行都設(shè)置為1，因?yàn)檫@兩個(gè)方向是沒有周期性的。（碳管沿著z方向）。第三行是為了計(jì)算電極部分的碳管用的，對于碳管這種體系，可能這個(gè)地方需要的k點(diǎn)數(shù)目比較多。需要做一個(gè)收斂測試。但是對于輸運(yùn)計(jì)算的時(shí)候，第三行就沒設(shè)么用了。只看第一二行。 |
3樓2010-11-08 09:40:28
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4樓2010-11-08 13:56:48
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SystemName SystemLabel %block ChemicalSpeciesLabel 1 1 H 2 6 C %endblock ChemicalSpeciesLabel PAO.EnergyShift 50 meV PAO.BasisType split PAO.BasisSize DZP %block kgrid_Monkhorst_Pack 1 0 0 0.0 0 1 0 0.0 0 0 20 0.0 %endblock kgrid_Monkhorst_Pack xc.functional GGA # Exchange-correlation functional xc.authors PBE # Exchange-correlation version SpinPolarized F # Logical parameters are: yes or no FixSpin F MeshCutoff 300. Ry # Equivalent plane wave cutoff for the grid # SCF options DM.Tolerance 1.d-4 # Tolerance in maximum difference between input and output DM MaxSCFIterations 1000 # Maximum number of SCF iter DM.UseSaveDM T # to use continuation files DM.MixingWeight 0.02 # New DM amount for next SCF cycle DM.NumberPulay 6 DM.MixSCF1 F DM.PulayOnFile F # Store in memory ('F') or in files ('T') # NeglNonOverlapInt T # 'F'=do not neglect SolutionMethod Diagon # OrderN or Diagon ElectronicTemperature 300 K # Temp. for Fermi smearing # MD options MD.TypeOfRun CG # Type of dynamics: MD.VariableCell F MD.NumCGsteps 100 # Number of CG steps for coordinate optimization %include POSITION.fdf 輸入文件差不多就是這個(gè)樣子的 有個(gè)問題用一個(gè)小的架構(gòu)優(yōu)化后supercell 力還是很大 只能再優(yōu)化么 有沒有好的辦法提高優(yōu)化速度 另外用siesta優(yōu)化和transiesta優(yōu)化的區(qū)別在哪里? |
6樓2010-11-08 14:25:10
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8樓2010-11-08 19:01:26
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9樓2010-11-08 19:49:18
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Dear Transiesta user: I have one question about the calculation of Transiesta. I am using Transiesta to calculate the transmission in nanowires. I am not sure about the optimization of the scattering region using siesta or transiesta. Since if I use siesta to optimize the scattering region, the results are not correct and if I use the Transiesta to optimize the scattering region, it can not converge . Could anybody help me? Thanks in advance. Lihong 我覺得我和他遇到的問題是一樣的 就是加上偏壓后力變得很大 |
10樓2010-11-09 17:09:46
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