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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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Me卓

木蟲 (正式寫手)

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[交流] 【求助成功】vasp認(rèn)識(shí)負(fù)的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)嗎？已有6人參與

算東西有段時(shí)間了，今天突然意識(shí)到一個(gè)問(wèn)題。我的POSCAR使用分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，但是有負(fù)的數(shù)值。我不知道vasp能不能認(rèn)識(shí)負(fù)的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，CONTCAR出來(lái)的貌似都是正值。如果vasp不認(rèn)識(shí)負(fù)值，那我豈不是白算了。請(qǐng)大家?guī)兔χ附桃幌�，謝謝！
這是我優(yōu)化一個(gè)甲醇分子的POSCAR：
CH3OH
15
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0 1 0
0 0 1
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Direct
0.07247  -0.00000 0.00000
0.09662  -0.03416  -0.05917
0.17036  -0.02883  -0.06235
0.03558  -0.04937 0.04448
0.02517 0.05584  -0.02052
0.13131 0.02936 0.03810
這是出來(lái)的CONTCAR：
CH3OH
15.0000000000000
   1.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000
   0.0000000000000000 1.0000000000000000 0.0000000000000000
   0.0000000000000000 0.0000000000000000 1.0000000000000000
1 1 4
Direct
  0.0711867625366919  0.0032946507459112  0.0055364472858323
  0.1066965840224323  0.9591722407947124  0.9283834707001456
  0.1709691013169874  0.9656345848337698  0.9286045536257209
  0.0345372273134889  0.9549076794189322  0.0468409299672217
  0.0245297680941611  0.0559113565150622  0.9844473870316466
  0.1235905567162498  0.0339194876916105  0.0467272113894312

[ Last edited by zzy870720z on 2010-11-11 at 23:00 ]

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1樓 2010-11-11 17:22:45

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Me卓

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Originally posted by sunyang1988 at 2010-11-11 18:05:26:

處理的是周期性體系，負(fù)值沒(méi)問(wèn)題，而且通過(guò)對(duì)比你的POSCAR與CONTCAR可以發(fā)現(xiàn)POSCAR中的負(fù)值都通過(guò)加了一個(gè)周期（+1）轉(zhuǎn)到晶胞內(nèi)了

謝謝你。我就是有點(diǎn)不明白，你看6個(gè)原子，只有這幾個(gè)原來(lái)是負(fù)值的Z坐標(biāo)加了1，那這樣不統(tǒng)一加減，能行嗎？因?yàn)槲铱创蠹艺{(diào)坐標(biāo)都是每個(gè)原子的三個(gè)方向的坐標(biāo)統(tǒng)一加減同樣的值

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3樓2010-11-11 21:54:02

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sunyang1988

至尊木蟲 (著名寫手)

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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
mazuju028(金幣+1):謝謝交流 2010-11-11 19:28:56

引用回帖:

Originally posted by Me卓 at 2010-11-11 17:22:45:
算東西有段時(shí)間了，今天突然意識(shí)到一個(gè)問(wèn)題。我的POSCAR使用分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，但是有負(fù)的數(shù)值。我不知道vasp能不能認(rèn)識(shí)負(fù)的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，CONTCAR出來(lái)的貌似都是正值。如果vasp不認(rèn)識(shí)負(fù)值，那我豈不是白算了。請(qǐng)大家?guī)兔χ附?...

處理的是周期性體系，負(fù)值沒(méi)問(wèn)題，而且通過(guò)對(duì)比你的POSCAR與CONTCAR可以發(fā)現(xiàn)POSCAR中的負(fù)值都通過(guò)加了一個(gè)周期（+1）轉(zhuǎn)到晶胞內(nèi)了

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心之所向無(wú)懼無(wú)悔

2樓2010-11-11 18:05:26

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zzy870720z

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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
sunyang1988(金幣+2):謝謝交流 2010-11-12 00:08:24

引用回帖:

Originally posted by Me卓 at 2010-11-11 21:54:02:

謝謝你。我就是有點(diǎn)不明白，你看6個(gè)原子，只有這幾個(gè)原來(lái)是負(fù)值的Z坐標(biāo)加了1，那這樣不統(tǒng)一加減，能行嗎？因?yàn)槲铱创蠹艺{(diào)坐標(biāo)都是每個(gè)原子的三個(gè)方向的坐標(biāo)統(tǒng)一加減同樣的值

周期結(jié)構(gòu)的特征就是有平移對(duì)稱性
當(dāng)然如果你感覺(jué)不爽，有負(fù)坐標(biāo)的方向可以整體平移0.5或其他值直到全是正值為止
建議看看固體物理學(xué)書籍

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博學(xué)、審問(wèn)、慎思、明辨、篤學(xué)

4樓2010-11-11 22:04:18

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Originally posted by zzy870720z at 2010-11-11 22:04:18:

周期結(jié)構(gòu)的特征就是有平移對(duì)稱性
當(dāng)然如果你感覺(jué)不爽，有負(fù)坐標(biāo)的方向可以整體平移0.5或其他值直到全是正值為止
建議看看固體物理學(xué)書籍

恩，謝謝。理論知識(shí)我是該補(bǔ)充

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5樓2010-11-11 22:11:30

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