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auybv金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助】Amber中同樣的初始文件多次運(yùn)行結(jié)果相同嗎？
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| 我用Amber做了一個(gè)很大的體系的動(dòng)力學(xué)模擬，每次5ns，總共運(yùn)行了25ns。最近不小心把從5ns到10ns的那個(gè)mdcrd文件刪了。如果還用5ns時(shí)的top和rst文件重新提交，計(jì)算到10ns時(shí)的結(jié)構(gòu)和以前那次計(jì)算的會完全相同嗎？Amber在進(jìn)行動(dòng)力學(xué)模擬的時(shí)候是否存在隨機(jī)因素？因?yàn)轶w系太大，運(yùn)行起來極其耗時(shí)，如果每次的結(jié)果都不同，那么后面的15ns也還要重新計(jì)算。謝謝。 |
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