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【討論】關(guān)于馳豫的討論
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各位大俠： 我有幾個(gè)問(wèn)題不是很明白，希望大家討論下，說(shuō)說(shuō)自己的看法 （1）馳豫是什么 ？ 在我看來(lái)，馳豫也是優(yōu)化的一種方式（另一種是構(gòu)型最優(yōu)化，即求在0k下該構(gòu)型的勢(shì)能最小值，這時(shí)算的時(shí)候好像用的全是自由邊界條件） （2）那馳豫應(yīng)該在什么系綜下進(jìn)行？nve？npt？ 還是nvt？ 有的人說(shuō)用nvt,我也不知道原因，也不知道為什么要用nvt？以及用nvt 跟用nve在馳豫中有什么本質(zhì)上的差別？ 我的看法是：用npt。因?yàn)樵趎pt下，構(gòu)型的box是可以改變的，那么原子的位置就能得到很好的松弛。 （3）馳豫過(guò)程中跟邊界條件的關(guān)系。 我認(rèn)為是很有關(guān)系的。在用nve的時(shí)候，我用s s s 邊界好像也能得到馳豫，這時(shí)候的馳豫我想應(yīng)該跟構(gòu)型最優(yōu)化差不多。邊界條件只要不全是周期邊界，nve就能馳豫 在lammps中而 nve+對(duì)原子的控溫 應(yīng)該也能達(dá)到馳豫的效果。 （4）馳豫到平衡態(tài)的標(biāo)準(zhǔn)是什么？？ 我的看法是：系統(tǒng)的溫度，能量，以及系統(tǒng)的壓強(qiáng)都達(dá)到了一個(gè)平衡值。 有的看法是，壓強(qiáng)要為0或者在0附件波動(dòng) 謝謝大家能都談?wù)勛约旱睦斫狻? |
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ghcacj(金幣+10, 模擬EPI+1):既然老虎不去領(lǐng)獎(jiǎng)帖領(lǐng)獎(jiǎng)， 那就在這把獎(jiǎng)給你 2010-12-14 17:06:00
ghcacj(金幣+50):這個(gè)是額外獎(jiǎng)勵(lì) 2010-12-14 17:06:08
ghcacj(金幣+50):這個(gè)是額外獎(jiǎng)勵(lì) 2010-12-14 17:06:18
黃隨便(金幣+10): 2011-05-30 14:54:42
ghcacj(金幣+10, 模擬EPI+1):既然老虎不去領(lǐng)獎(jiǎng)帖領(lǐng)獎(jiǎng)， 那就在這把獎(jiǎng)給你 2010-12-14 17:06:00
ghcacj(金幣+50):這個(gè)是額外獎(jiǎng)勵(lì) 2010-12-14 17:06:08
ghcacj(金幣+50):這個(gè)是額外獎(jiǎng)勵(lì) 2010-12-14 17:06:18
黃隨便(金幣+10): 2011-05-30 14:54:42
| 馳豫就是relax，就是松馳，釋放內(nèi)部應(yīng)力，使系統(tǒng)達(dá)到平衡。因此分子模擬中所說(shuō)的馳豫在廣義上往往就是指的run。運(yùn)行MD多少步，也可以說(shuō)弛豫多少步。在什么條件下弛豫，看你的具體對(duì)象和過(guò)程。也有特定過(guò)程的馳豫，比如有的文獻(xiàn)上說(shuō)達(dá)到平衡后再馳豫多少步，等等，但仍然看不出來(lái)這個(gè)詞和 run 有什么區(qū)別�？傊^的“弛豫”，并不是一個(gè)專門有所指的術(shù)語(yǔ)，并不是特指的某一個(gè)過(guò)程，也不是限定在某個(gè)條件下進(jìn)行的過(guò)程。 分子模擬的文獻(xiàn)中出現(xiàn)幾乎所有的”馳豫“兩個(gè)字，如果換成”運(yùn)行“，它的意思不會(huì)發(fā)生什么變化。馳豫多少步，基本上就等同于運(yùn)行多少步的意思。因?yàn)轳Y豫二字強(qiáng)調(diào)的是應(yīng)力松馳，而在某個(gè)指定條件下，任何成功的MD步所產(chǎn)生的都是這個(gè)效果，而不是相反。 |
2樓2010-12-14 11:31:57
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