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【求助】繼續(xù)求助doml計算過渡態(tài)的問題
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在拿dmol計算固體表面解離過渡態(tài)時我的流程是這樣的： 1： 因為不知道確定的初態(tài)和終態(tài)位置所以我假定了一個初態(tài)和終態(tài)（從文獻上看的大體在那個位置，精確的就不知道啦）進行reaction preview我先進行ts-confrimation在給出的1-2.xcd（1,2 表示假定的初態(tài)和終態(tài)）找到相對應(yīng)的初態(tài)最低點11和終態(tài)最低點22。 2：優(yōu)化11和22同時計算freq，確保11和22沒有虛頻也就是保證11 和22 結(jié)構(gòu)很穩(wěn)定。得到111和222 3：以111 和222做reaction preview進行ts-search計算頻率（問題就出現(xiàn)在這，算出來三個虛頻一個-1500多一個-200一個-70。-1500是我想要的振動模式其他兩個都是平動幅度也很�。� 問題一：我想消去那兩個不想要的虛頻，按照小木蟲上的針對dmol消虛頻的小程序，把原子做啦調(diào)整，我應(yīng)該是計算能量和頻率還是優(yōu)化結(jié)構(gòu)和頻率？ 問題二：這個流程對不對？應(yīng)該怎樣做？ 設(shè)想二我這樣做 1：因為不知道確定的初態(tài)和終態(tài)位置所以我假定了一個初態(tài)和終態(tài)（從文獻上看的大體在那個位置，精確的就不知道啦）進行reaction preview我先進行ts-confrimation在給出的1-2.xcd（1,2 表示假定的初態(tài)和終態(tài)）找到相對應(yīng)的初態(tài)最低點11和終態(tài)最低點22。 2：在11、22分別和ts-confrimation中最高點3進行ts-search看有沒有能量最高的點虛頻是不是一個 這兩種方法那個好一些，還是兩個都有問題��？到底過渡態(tài)再沒找��？愁啊 [ Last edited by lishufei on 2010-12-16 at 10:26 ] |
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