快樂至上7868

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[交流] 【求助】怎樣用Gview看HOMO，LUMO軌道

已經(jīng)得到了優(yōu)化好的幾何構(gòu)型，現(xiàn)在需要分析分子的HOMO跟LUMO軌道
我現(xiàn)在的方法是，首先formchk優(yōu)化好的幾何構(gòu)型的chk文件，然后使用以下命令
cubegen 0 mo=homo *.fchk *.cub 0
得到的*.cube文件使用gview看結(jié)果，顯示No MOs available，用Chem3D看的圖是第一個圖，而我想要的是第二個圖。
不知道哪里出了問題？還請大家指點一下，萬分感謝！
我的*.cube文件如下
1-scan 2010 1214 mo=homo
MO coefficients
  -72  -21.821550  -14.004084 -9.360395
  121 0.364585 0.000000 0.000000
81 0.000000 0.364585 0.000000
52 0.000000 0.000000 0.364585
6 6.000000 -5.495631 -0.425731 1.939299
6 6.000000 -2.870723 -0.406900 2.041871
  ........
-6.00239E-12 -1.32209E-11 -2.78898E-11 -5.63447E-11 -1.09010E-10 -2.01956E-10
-3.58263E-10 -6.08524E-10 -9.89590E-10 -1.54066E-09 -2.29618E-09 -3.27582E-09
-4.47322E-09 -5.84621E-09 -7.31224E-09 -8.75217E-09 -1.00239E-08 -1.09845E-08
  .......................

[ Last edited by 快樂至上7868 on 2010-12-17 at 01:30 ]

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1樓 2010-12-17 00:37:27

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小紅豆

主管區(qū)長 (知名作家)

★
快樂至上7868(金幣+5):謝謝參與

樓主是否保存了計算是產(chǎn)生的CHK文件？

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2樓2010-12-17 09:32:50

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gougaozhan

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★ ★ ★ ★
快樂至上7868(金幣+5):謝謝參與
小紅豆(金幣+3):感謝交流 2010-12-17 09:54:20

應(yīng)該沒有出錯，你調(diào)節(jié)chemoffice 里的surfaces——isocontour，應(yīng)該就可以看了。但首先要讓顯示出HOMO，LUMO圖來

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3樓2010-12-17 09:42:12

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manson1998

金蟲 (著名寫手)

★ ★ ★
快樂至上7868(金幣+5):謝謝參與
小紅豆(金幣+2):鼓勵交流 2010-12-17 10:12:19

直接用gv可以打開chk就可以看

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4樓2010-12-17 09:57:58

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fatpig8832

鐵桿木蟲 (著名寫手)

★ ★ ★
快樂至上7868(金幣+5):謝謝參與
小紅豆(金幣+2):感謝交流 2010-12-20 08:26:30

gaussview 5.08-->File-->Open-->*.fchk-->open-->Edit-->MOs-->Visualize-->Update

gv其他版本應(yīng)該也一樣吧...

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5樓2010-12-17 10:24:38

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引用回帖:

Originally posted by 小紅豆 at 2010-12-17 09:32:50:
樓主是否保存了計算是產(chǎn)生的CHK文件？

都保存了的

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6樓2010-12-17 12:16:04

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★ ★
小紅豆(金幣+2):感謝交流 2010-12-20 08:27:13

引用回帖:

Originally posted by fatpig8832 at 2010-12-17 10:24:38:
gaussview 5.08-->File-->Open-->*.fchk-->open-->Edit-->MOs-->Visualize-->Update

gv其他版本應(yīng)該也一樣吧...

visualize的選項是灰的，不能選，可以看到軌道，但是得不到我想要的第二個圖，這是什么原因呢？

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7樓2010-12-17 12:27:12

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fatpig8832

鐵桿木蟲 (著名寫手)

★ ★
快樂至上7868(金幣+15): 2010-12-20 03:29:53
小紅豆(金幣+2):感謝交流 2010-12-20 08:27:22

引用回帖:

Originally posted by 快樂至上7868 at 2010-12-17 12:27:12:

visualize的選項是灰的，不能選，可以看到軌道，但是得不到我想要的第二個圖，這是什么原因呢？

是不是fchk文件，跟chk不同的...

你可以算個h2o試試，弄出fchk文件再用上面的步驟看看是否有圖出現(xiàn)

通常直接打開log文件就會出現(xiàn)visualize的選項是灰的...

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8樓2010-12-17 12:34:51

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gmy1990

榮譽(yù)版主 (著名寫手)

★ ★ ★ ★
快樂至上7868(金幣+5):謝謝參與
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小紅豆(金幣+3):感謝交流 2010-12-20 08:27:35

gaussview 5.08-->File-->Open-->*.fchk-->open-->Results-->Surfaces/Conrtours-->Cube actions-->New action-->Surface action 就可以了，你的分子比較大，時間會長些

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9樓2010-12-19 14:05:39

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gmy1990

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★ ★ ★
小紅豆(金幣+3):感謝交流 2010-12-20 08:27:44

可以先把默認(rèn)得計算基組改大些

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10樓2010-12-19 14:10:10

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引用回帖:

Originally posted by gmy1990 at 2010-12-19 14:05:39:
gaussview 5.08-->File-->Open-->*.fchk-->open-->Results-->Surfaces/Conrtours-->Cube actions-->New action-->Surface action 就可以了，你的分子比較大，時間會長些

非常感謝，用這個方法就可以了。

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11樓2010-12-20 03:28:50

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快樂至上7868(金幣+5):謝謝參與

按這個試確實可以

引用回帖:

Originally posted by fatpig8832 at 2010-12-17 10:24:38:
gaussview 5.08-->File-->Open-->*.fchk-->open-->Edit-->MOs-->Visualize-->Update

gv其他版本應(yīng)該也一樣吧...

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12樓2010-12-21 02:33:05

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