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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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淡到極致

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[交流] 【求助】glide 對(duì)接的分?jǐn)?shù)是-8.41，可以嗎？多少算對(duì)接成功？

讓別人幫我做的，他也不懂。我想問(wèn)問(wèn)，glide對(duì)接的分?jǐn)?shù)多少算可以？為什么是負(fù)值？
謝謝！

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1樓 2010-12-17 14:02:37

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大俠們都還沒(méi)上班嗎？冒個(gè)泡泡啊

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2樓2010-12-17 14:22:42

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是不是金幣太少了？如果有人回答，那我再加金幣吧

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3樓2010-12-17 16:13:47

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ferlich

禁蟲(chóng) (小有名氣)

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ghcacj(金幣+1):謝謝 2010-12-23 15:51:19

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4樓2010-12-17 16:52:24

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houxuben

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zh1987hs(金幣+2):謝謝 2010-12-19 23:02:08
ghcacj(金幣+2):謝謝 2010-12-23 15:51:25

把蛋白里帶的配體抽出或者自己畫(huà)一個(gè)活性高的配體，作為參照，跟你的這個(gè)放在一塊對(duì)接，比較一下SCORE即可

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5樓2010-12-19 18:19:13

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Originally posted by ferlich at 2010-12-17 16:52:24:
單獨(dú)看一個(gè)對(duì)接的話，絕對(duì)分?jǐn)?shù)沒(méi)什么意義

=============================
那分?jǐn)?shù)到底有什么用？怎樣知道結(jié)果好不好呢？

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6樓2010-12-21 22:26:57

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Originally posted by houxuben at 2010-12-19 18:19:13:
把蛋白里帶的配體抽出或者自己畫(huà)一個(gè)活性高的配體，作為參照，跟你的這個(gè)放在一塊對(duì)接，比較一下SCORE即可

================================
O(∩_∩)O謝謝
這個(gè)配體本來(lái)就是自己畫(huà)的，加進(jìn)去的呀，不太明白你的意思

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7樓2010-12-21 22:27:58

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ferlich

禁蟲(chóng) (小有名氣)

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zh1987hs(金幣+2):謝謝 2010-12-23 10:33:41
淡到極致(金幣+10):O(∩_∩)O謝謝 2010-12-27 10:03:53

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8樓2010-12-22 16:33:53

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zh1987hs(金幣+2):謝謝 2010-12-23 11:19:05
ghcacj(金幣+3):謝謝 2010-12-23 15:51:38

引用回帖:

Originally posted by 淡到極致 at 2010-12-21 22:27:58:

================================
O(∩_∩)O謝謝
這個(gè)配體本來(lái)就是自己畫(huà)的，加進(jìn)去的呀，不太明白你的意思

自己畫(huà)的就不太好比較了，你看看有沒(méi)有你的靶點(diǎn)有沒(méi)有protein-ligand 復(fù)合物，里面有配體的三維晶體結(jié)構(gòu)，可以用來(lái)當(dāng)做參比分子。要是你自己畫(huà)的，它的真實(shí)三維結(jié)構(gòu)可就不好說(shuō)了。。。。。還有就是看下說(shuō)明書(shū)，我沒(méi)用過(guò)glide，但是記得surflexdock說(shuō)明書(shū)了說(shuō)過(guò)score大于4是acceptale~祝好運(yùn)。

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9樓2010-12-23 11:15:00

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jumper158

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小木蟲(chóng)(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
zh1987hs(金幣+1):謝謝 2011-01-14 16:36:06

還行，不是很壞，他那個(gè)打分時(shí)結(jié)合能量的一種度量

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10樓2011-01-14 13:19:05

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