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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 第一性原理 » MS » 【求助】急需幫忙
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convenient鐵蟲 (小有名氣)
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【求助】急需幫忙 已有4人參與
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| 用CASTEP優(yōu)化計算，停電后如何接著優(yōu)化？一周內(nèi)停電兩次悲哀�。∠Ｍ呤种更c。 |
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5樓2010-12-29 13:01:30
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
youzhizhe(金幣+5): 謝謝交流。 2011-03-20 14:12:12
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首先聲明，最省事的方法是對未優(yōu)化完的模型接著優(yōu)化，保持計算參數(shù)不變（相當于多步優(yōu)化嘛）。 其次，可以接著斷電前的計算繼續(xù)，但是有條件的。要想castep能夠斷電后重用原來的計算結果繼續(xù)跑，要滿足下面的條件： 1- check文件存在。 2- check文件是健全。 或者說，check文件中至少又一次完整而成功的 num_backup_iter 所定義的 幾何優(yōu)化或分子動力學 計算完成的條件下，相應的計算結果才能被寫入check文件。 默認的行為，對于幾何優(yōu)化來說，是每五步bfgs完成后，才會執(zhí)行一次check文件寫入操作，這個行為是靠下面的參數(shù)控制的： num_backup_iter 所以，如果對于每一步都很耗時的計算來說，最好在param文件中作下面的設定： num_backup_iter : 1 即使如此，有的時候我們能夠看到check文件，也不能保證此check文件時可用的，用數(shù)據(jù)庫的語言來說，其中存在“臟數(shù)據(jù)”。這時候，可以看一下，在計算的結果目錄中，是否還有一個.check_bak(似乎是這個名字或類似的名字)存在，這個是castep為了防止check文件由于意外的不可抗力造成的損壞而定時對check文件自動備份得到的。 如果這個文件存存在，只要刪除原來的check文件，然后將此文件改名為check文件的名字，既可。 3- 如果上面的兩個條件都已經(jīng)滿足，則只需要在param文件中僅僅使用下面的一行，就可以了： continuation : seedname.check 這里的seedname，就是你的job的名字。 還可以看看這個帖子：http://www.gaoyang168.com/html/200807/903708.html [ Last edited by xianggui7895 on 2010-12-29 at 13:42 ] |
6樓2010-12-29 13:39:53
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