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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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山石巖

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[交流] 【求助】菜鳥(niǎo) 求助批量化合物轉(zhuǎn)化為3D

求助

我對(duì)設(shè)計(jì)不是很了解，現(xiàn)在想轉(zhuǎn)化一批化合物為3D結(jié)構(gòu)，大概有幾萬(wàn)個(gè)化合物。這些化合物的格式都是sd的。

開(kāi)始用DS的Build 3D database .發(fā)現(xiàn)1000個(gè)化合物轉(zhuǎn)化用了12個(gè)小時(shí)，崩潰了。請(qǐng)教下大家：這么長(zhǎng)時(shí)間正常嗎？還是用錯(cuò)了模塊或者軟件？還有什么方法能比這個(gè)快一點(diǎn)？具體要怎么操作��？

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1樓 2010-12-31 09:45:28

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yalefield

金蟲(chóng) (文壇精英)

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zh1987hs(金幣+1):謝謝 2011-01-11 22:38:18

openbabel

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2樓2011-01-01 09:15:34

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tjegg

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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zh1987hs(金幣+1):謝謝 2011-01-11 22:38:25

SYBYL的concord

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4樓2011-01-02 09:23:20

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houxuben

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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zh1987hs(金幣+1):謝謝 2011-01-11 22:37:55

同意樓上
SYBYL的concord轉(zhuǎn)換8W個(gè)化合物也就是十來(lái)分鐘

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5樓2011-01-02 23:21:26

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山石巖

金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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Originally posted by 山石巖 at 2010-12-31 09:45:28:
求助

我對(duì)設(shè)計(jì)不是很了解，現(xiàn)在想轉(zhuǎn)化一批化合物為3D結(jié)構(gòu)，大概有幾萬(wàn)個(gè)化合物。這些化合物的格式都是sd的。

開(kāi)始用DS的Build 3D database .發(fā)現(xiàn)1000個(gè)化合物轉(zhuǎn)化用了12個(gè)小時(shí)，崩潰 ...

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6樓2011-01-10 18:59:45

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山石巖

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Originally posted by CYXLP at 2011-01-01 09:40:51:

謝謝

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7樓2011-01-10 19:00:25

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8樓2011-01-10 19:01:22

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同意樓上
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9樓2011-01-10 19:01:44

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CYXLP3樓

2011-01-01 09:40 回復(fù)

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