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043114076木蟲 (正式寫手)
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[交流]
【討論】cif 晶體文件格式轉(zhuǎn)化 已有3人參與
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想編一個fortran程序批量的將cif文件轉(zhuǎn)化為xyz文件或者pdb文件，遇到的問題是空間向量的讀取無法識別。 以下是cif文件中空間操作向量的定義： loop_ _symmetry_equiv_pos_site_id _symmetry_equiv_pos_as_xyz 1 x,y,z 2 -x,-y,1/2+z 3 1/2-x,1/2+y,1/2+z 4 1/2+x,1/2-y,z 如何將空間向量讀取為表達式，生成所有的等價坐標？ 我目前想到的方法是使用shell腳本而無法用fotran來實現(xiàn)，但是缺點是移植性不好，輸出控制也不好。 不知大家有什么辦法能實現(xiàn)字符串與表達式之間的轉(zhuǎn)換。 |
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ghcacj
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2樓2011-01-04 17:09:43
043114076
木蟲 (正式寫手)
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3樓2011-01-04 20:17:28
winterz
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
ghcacj(金幣+2):謝謝 2011-01-06 09:17:10
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LZ可以試一下OpenBabel http://openbabel.org/wiki/Main_Page |
4樓2011-01-05 18:17:20
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