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【求助成功】急求linux中DMol3的inputfile腳本編寫格式？
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本人在win版MS中save file得到seedfile.input和seedfile.car兩個(gè)文件，上傳至服務(wù)器，然后用RunDMol3.sh運(yùn)行seedfile，提示line contains an unrecognized keyword。本人將關(guān)鍵詞的內(nèi)容用括號(hào)替代，也提示錯(cuò)誤，請(qǐng)高手指點(diǎn)！ # Task_parameters^M <-- Calculate(optimize)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: calculate(optimize)^M Opt_energy_convergence(1.0000e-005)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: opt_energy_convergence(1.0000e-005)^M Opt_gradient_convergence(2.0000e-003^A)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: opt_gradient_convergence(2.0000e-003^a)^M Opt_displacement_convergence(5.0000e-003^A)^M <-- Error: INPUT_DMOL error: line contains an unrecognized keyword: opt_displacement_convergence(5.0000e-003^a)^M Opt_iterations(50)^M [ Last edited by lwg020810 on 2011-1-8 at 10:00 ] |
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2樓2011-01-07 15:10:10
★ ★ ★
sunyang1988(金幣+3):謝謝總結(jié) 2011-01-08 12:35:29
sunyang1988(金幣+3):謝謝總結(jié) 2011-01-08 12:35:29
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本人慣用MS的server/computer client任務(wù)提交模式，而單獨(dú)只在server上提交任務(wù)的standalone模式不是很了解，經(jīng)多位蟲友和qq群友的幫忙，現(xiàn)已解決。其實(shí)很簡單 第一步，在win版MS中的得到.car和.input文件 第二步，將兩文件上傳至server，保證文件夾內(nèi)有一個(gè)RunDMol3.sh即可 第三步，由于win版格式不能在linux系統(tǒng)正常讀取，需轉(zhuǎn)換.input文件格式，命令為dos2unix .input 回車即可 RunDMol3.sh seedfile就可以計(jì)算了 另一種轉(zhuǎn)換input文件格式的方式是（沒試過），在linux中vi .input，將內(nèi)容復(fù)制粘貼應(yīng)該也是可以的。 |
3樓2011-01-08 10:14:32
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