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sinokang至尊木蟲 (職業(yè)作家)
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[交流]
【求助】gromacs 4.0 不能并行 已有1人參與
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在戴爾T5400工作站（8核）上進行能量最小化時，不能并行： One of the processes started by mpirun has exited with a nonzero exit code. This typically indicates that the process finished in error. If your process did not finish in error, be sure to include a "return 0" or "exit(0)" in your C code before exiting the application. PID 20492 failed on node n0 (192.168.03) with exit status 1. 錯誤顯示為： There is no domain decomposition for 8nodes that is compatible with the given box and a minimum cell size of 11.6634 nm Change the number of nodes or mdrun option -rdd or -dds Look in the log file for details on the domain decomposition 不明白，之前跑相同的蛋白使用相同的mdp文件是沒問題的，試著改變nodes數(shù)目，還是這樣，請大家指點，謝謝 |
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2樓2016-06-01 15:29:46
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