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lwg020810

金蟲(chóng) (小有名氣)

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[交流] 【求助】怎樣考慮氣體分子在納米管或石墨烯上的物理吸附？（急）

在計(jì)算氣體分子在一維或二維納米材料上吸附時(shí)，既要考慮物理吸附又要考慮化學(xué)吸附，化學(xué)吸附的穩(wěn)定構(gòu)型通過(guò)幾何優(yōu)化容易得到，但是物理吸附的最低能量結(jié)構(gòu)怎么得到？
我重復(fù)了一篇文獻(xiàn)中的物理吸附，直接拿文獻(xiàn)中提到的穩(wěn)定構(gòu)型幾何優(yōu)化，結(jié)果是納米管出現(xiàn)了嚴(yán)重的形變，我查找了另一些文獻(xiàn)，文中有提到做物理吸附勢(shì)能面，用DMol這個(gè)勢(shì)能面又要怎么做？
請(qǐng)各位大俠指點(diǎn)

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1樓 2011-01-16 10:55:24

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qphll

金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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★ ★ ★
zzy870720z(金幣+3): 謝謝詳細(xì)指教 2011-01-25 09:03:47

引用回帖:

Originally posted by frank_zhan at 2011-01-18 20:18:52:
計(jì)算物理吸附的時(shí)候，應(yīng)該是要注意控制吸附氣體和表面的距離吧。

同意.

考慮物理吸附的勢(shì)能面, 可以從很遠(yuǎn)處(大于10angstrom)將分子逐步移動(dòng)靠近碳管, 然后在每個(gè)距離點(diǎn)上做fix point optimization, 這樣得到能量與距離的曲線.

比如, 如果計(jì)算CO2

D = 10.0 A , 固定CO2的COM和碳管表面某C原子的距離,  然后geometry optimization, 得到E1;

D= 9.5 A, 固定CO2的COM和碳管表面某C原子的距離,  然后geometry optimization, 得到E2;

D= 9.0 A, 固定CO2的COM和碳管表面某C原子的距離,  然后geometry optimization, 得到E3;

.... 以此類(lèi)推....

修改VDW參數(shù), 可以相同距離下, 不同VDW氣體的吸附強(qiáng)弱. 但是不要忘記, DFT對(duì)于dispersion的描述, 是天生的一個(gè)'缺陷'. 似乎現(xiàn)在還沒(méi)有完美解答....
所以修改VDW參數(shù)得到的比較, 只是一個(gè)參考值.

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4樓2011-01-25 06:21:48

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study163

木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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★
zzy870720z(金幣+1): 鼓勵(lì)交流 2011-01-18 16:39:47
lwg020810(金幣+2): 謝謝指點(diǎn)，我考慮使用constrain管也能得到穩(wěn)定吸附，不知是否可以，JMC，20，10426 2011-01-18 21:49:39

物理吸附不應(yīng)該出現(xiàn)碳管出現(xiàn)大的變形啊，你看的是哪篇文章？

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2樓2011-01-18 15:46:45

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frank_zhan

金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

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★
zzy870720z(金幣+1): 謝謝指教 2011-01-18 21:31:45
lwg020810(金幣+2): 物理吸附相互作用力主要是vdW力，考慮相關(guān)原子的vdW半徑就應(yīng)該可以吧 2011-01-18 21:45:23

計(jì)算物理吸附的時(shí)候，應(yīng)該是要注意控制吸附氣體和表面的距離吧。

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3樓2011-01-18 20:18:52

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小蟲(chóng)_sang

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★
小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖

引用回帖:

4樓: Originally posted by qphll at 2011-01-25 06:21:48
同意.

考慮物理吸附的勢(shì)能面, 可以從很遠(yuǎn)處(大于10angstrom)將分子逐步移動(dòng)靠近碳管, 然后在每個(gè)距離點(diǎn)上做fix point optimization, 這樣得到能量與距離的曲線.

比如, 如果計(jì)算CO2

D = 10.0 A , 固定C ...

請(qǐng)問(wèn)怎么固定CO2到碳管距離，然后進(jìn)行優(yōu)化呢？是在“modify-constraints”中設(shè)置的嗎？請(qǐng)教具體操作？？
另外，此距離是指CO2質(zhì)量中心到碳管的距離吧？
謝謝~

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5樓2014-04-03 17:09:50

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