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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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cjlcjl8592

木蟲 (著名寫手)

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[交流] 【求助】投稿回信中的單晶結(jié)構(gòu)問題？？？急�。�

我的投稿回信中的三個晶體學(xué)問題，希望知道的朋友告之，謝謝。急�。�！

1) For Complex 1, the esd of the c cell parameter is given as (0)!
為什么the esd of the c cell parameter會是（0）？為什么？
應(yīng)該如何處理？？如何答復(fù)審稿人？？謝謝。

2) In complex 2, it is apparent from the CIF that some disorder of N3/C3 has been modelled; however, this has been done incorrectly leading to a non integer formula (C80.58 H68 Cl6 Cu2 N5.42 O8 P4). This should be corrected in the refinement and a revised CIF submitted to CCDC. The disorder and its treatment should be briefly mentioned in the experimental.
這個問題最好應(yīng)該如何處理？？
我最開始是采用N3+C3的總的占有率為1，現(xiàn)在我改為N3為0.5，C3也為0.5，chemical formula(C81 H68 Cl6 Cu2 N5 O8 P4)應(yīng)該沒有問題了。但應(yīng)該如何回答這個問題，以及如何在the experimental 進行描述。謝謝。

3) A small point - but, the absorption correction stated in the manuscript is SADABS, the reference given in the CIF is for SORTAV - which one is correct.
這個問題應(yīng)該如何修改和答復(fù)？
我現(xiàn)在將the reference given in the CIF is for SORTAV changing into SADABS, 不知道是否可行。謝謝！但應(yīng)該如何回答。

[ Last edited by cjlcjl8592 on 2011-2-9 at 10:54 ]

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1樓 2011-02-09 10:53:13

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454106649

木蟲 (著名寫手)

·

★
cjlcjl8592(金幣+1):謝謝參與
cjlcjl8592(金幣+10): 感謝兄弟的幫助。 2011-02-09 12:07:18

第一個好像是晶胞參數(shù)沒有誤差吧！到原始的INS文件找找看有沒有，復(fù)制過去，或者重新xprep，再不行就是數(shù)據(jù)本身的問題了！找個牛人看看能不能亂寫一個（不提倡）。
第二個是無序裂分沒做好，改完就好了！
第三個沒遇見過，好像就是要你統(tǒng)一說法吧！
改完回人家說，你已經(jīng)認真改正了錯誤，新的文件發(fā)過去就好了吧！
以上均小碩個人意見，歡迎批評指正�。�！

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2樓2011-02-09 11:12:51

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guosuyi

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cjlcjl8592(金幣+1):謝謝參與

路過，學(xué)習(xí)

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3樓2011-02-09 11:20:21

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freelemon

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cjlcjl8592(金幣+1):謝謝參與

學(xué)習(xí)學(xué)習(xí)，很高深啊

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4樓2011-02-09 11:25:34

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tangbohejin

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cjlcjl8592(金幣+1):謝謝參與

????---

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5樓2011-02-09 11:26:43

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cjlcjl8592

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引用回帖:

Originally posted by 454106649 at 2011-02-09 11:12:51:
第一個好像是晶胞參數(shù)沒有誤差吧！到原始的INS文件找找看有沒有，復(fù)制過去，或者重新xprep，再不行就是數(shù)據(jù)本身的問題了！找個牛人看看能不能亂寫一個（不提倡）。
第二個是無序裂分沒做好，改完就好了！
第三個 ...

最原始的ins文件如下：
TITL shelxl in P-1
CELL 0.71073 9.3730  11.9931  13.4768  72.546  76.044  81.717
ZERR 8.00 0.0003 0.0005 0.0000 0.009 0.009 0.009
LATT  1
SFAC C H N O P CL CU I
UNIT 8 8 8 8 8 8 8 8
TREF
HKLF 4
END

假如是數(shù)據(jù)本身的問題要怎么辦？？
找個牛人看看能不能亂寫一個（我也不提倡，這是篡改數(shù)據(jù)）。

原始的p4p文件如下：
FILEID  Cell Parameters from crystalclear
SITEID
TITLE Cell Parameters
CHEM  ?
CELL    9.3730 11.9931 13.4768 72.5458 76.0444 81.7171 1398.319
CELLSD    .0003    .0005    .0000    .0089    .0088    .0087

原始的crystalclear.cif文件部分數(shù)據(jù)如下：
#-----------------------------------------------------------
_cell_length_a                         9.3730(3)
_cell_length_b                         11.9931(5)
_cell_length_c                         13.4768(0)
_cell_angle_alpha                      72.5458(89)
_cell_angle_beta                      76.0444(88)
_cell_angle_gamma                      81.7171(87)
_cell_volume                            1398.3192(0)
_cell_formula_units_Z                2
_cell_measurement_temperature          293.1500
_cell_measurement_reflns_used          2729
_cell_measurement_theta_min          2.0529
_cell_measurement_theta_max          27.4642
_symmetry_space_group_name_H-M       'P1'
#-----------------------------------------------------------

[ Last edited by cjlcjl8592 on 2011-2-9 at 12:31 ]

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6樓2011-02-09 12:22:45

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454106649

木蟲 (著名寫手)

cjlcjl8592(金幣+5): 謝謝！ 2011-02-09 12:53:29

引用回帖:

Originally posted by cjlcjl8592 at 2011-02-09 12:22:45:

最原始的ins文件如下：
TITL shelxl in P-1
CELL 0.71073 9.3730 11.9931 13.4768 72.546 76.044 81.717
ZERR 8.00 0.0003 0.0005 0.0000 0.009 0.009 0.009
LATT 1
SFAC C ...

我經(jīng)驗比較淺，沒什么好方法！你可以重新吸收校正試試，問問收數(shù)據(jù)的老師吧，看看好不好解釋一下！實在不行只能重新培養(yǎng)，重收數(shù)據(jù)了！

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7樓2011-02-09 12:50:11

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cluster8676

至尊木蟲 (著名寫手)

★
cjlcjl8592(金幣+1):謝謝參與

1. 你這個在check晶體的時候也是沒有誤差的么？問一下收晶體的老師，看看在smart上面顯示的有沒有誤差。
2. 這個應(yīng)該是N和C的無序，一般情況下是不要改為0.5 0.5 的，應(yīng)該精修一下，每一個原子在這兩個位置上的占有率不一定是50-50.
3. 應(yīng)該是你做cif文件的時候用的reference的文件里面給的是SORTAV但是實際上你用的是SADABS，

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8樓2011-02-09 13:39:03

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qianbh

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學(xué)習(xí)一下！

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9樓2011-02-09 14:30:37

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yunruirui

榮譽版主 (著名寫手)

★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流

其他兩個如二樓所說，第三個就是你給的參考和實際用的吸收矯正程序用的不一致

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10樓2011-02-09 14:46:01

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cjlcjl8592

木蟲 (著名寫手)

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引用回帖:

Originally posted by cluster8676 at 2011-02-09 13:39:03:
1. 你這個在check晶體的時候也是沒有誤差的么？問一下收晶體的老師，看看在smart上面顯示的有沒有誤差。
2. 這個應(yīng)該是N和C的無序，一般情況下是不要改為0.5 0.5 的，應(yīng)該精修一下，每一個原子在這兩個位置上的占 ...

謝謝！
1. 晶體收了很久了，我不知道收晶體的老師還有沒有原始數(shù)據(jù)，并且是否記得。晶體結(jié)構(gòu)是自己解析的，在傳給我的原始晶體數(shù)據(jù)里能否找到這樣的原始數(shù)據(jù)呀？
2. N和C的無序的，投稿時cif文件中采用的占有率不是固定的，是精修后得到的，因此出現(xiàn)化學(xué)式不是整數(shù)的情況(C80.58 H68 Cl6 Cu2 N5.42 O8 P4) ，與實際的化學(xué)式不符合（我一個朋友幫我的精修的）.
現(xiàn)在沒辦法，我只好將N和C的占有率固定，分別設(shè)定為0.5，現(xiàn)在我發(fā)現(xiàn)化學(xué)式是整數(shù)了(C81 H68 Cl6 Cu2 N5 O8 P4)，與真正的化學(xué)式也符合，但我卻不知道這樣做是否可行？？？
3、我做cif文件的時候用的reference的文件里面給的是SORTAV，但實際上我用的是SADABS。我現(xiàn)在只要將reference的文件里面給的是SORTAV改為SADABS，并說明一下就可以了？？？
麻煩兄弟了。

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11樓2011-02-09 18:09:21

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cluster8676

至尊木蟲 (著名寫手)

★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流

1. 如果你有原始數(shù)據(jù)的話，找一下有沒有ini文件，smart可以讀ini文件。
2. 在做無序處理的時候，如果無序做的對的話，你的化學(xué)式是不應(yīng)該出現(xiàn)小數(shù)的。不建議限定占有率。你可以把你的ins文件關(guān)于無序部分發(fā)上來看看。
3. 你那樣該應(yīng)該沒有問題。

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12樓2011-02-10 02:47:08

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