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xiamr金蟲 (小有名氣)
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[交流]
【求助/交流】AMOVA 分子方差分析 已有6人參與
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大家好 遇到 軟件上的頭疼事 請大家?guī)蛡�忙 我現(xiàn)在進(jìn)行AMOVA 分子方差分析，不知道 怎么用Arlequin 這個軟件 請大家賜教�。� 越詳細(xì)越好，從序列的分析開始》》》 haha-1996@163.com |
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6樓2011-03-10 18:39:57
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DNA數(shù)據(jù)Arlequin預(yù)處理格式，希望對各位有幫助
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小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖交流
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[Profile] Title="mtDNA sequences in the Senegalese Mandenka (hypervariable region 1)" #Data from : #Graven, L., Passarino, G., Semino, O., Boursot, P., Santachiara-Benerecetti, A. S., #Langaney, A., and Excoffier, L., 1995, Evolutionary correlation between #control region sequence and RFLP diversity pattern in the mitochondrial genome #of a Senegalese sample, Mol. Biol. Evol. 12(2):334-345 （#后的文字是提示，軟件不讀�。� NbSamples=1 GenotypicData=0 DataType=DNA LocusSeparator=NONE MissingData='?'（將GAP換成？或者將這里的？換成-，要統(tǒng)一） [Data] [[Samples]] SampleName="Mandenka" #Reference: Graven et al. 1995 Mol. Biol. Evol. 12:334-345. SampleSize=8（序列總個數(shù)） SampleData= { 名稱 個數(shù) 序列（不知道為什么發(fā)言框里自動換行了，但是編輯時一個序列一行，不要換行） 01 6 ATTAGCACCCAAAGCTAAGATTCTAATTTAAACTATTCTCTGTTCTTTCATGGGGA GCAGATTTGGGTACCACCCAAGTATTGACTCACCCATCAACAACCGCTATGTATTTCGTACATTACTGCCAGCCACCATGAATATTGTACGGTACCATAAATACTTGACTATCTGTAGTACATAAAAACCCAAT--CCACATCAAAA-----CCCCCTCCCCATGCTTACAAGCAAGTACAGCAATCAACCTTCAACTATCACACATCAACTGCAACTCCAAAGCCA-CCCCTCACCCACTAGGATATCAACAAACCTACCCATCCTTAACAGTACATAGTACATAAAGCCATTTACCGTACATAGCACATTACAGTCAAATCCTTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCCC 02 2 ???????????????????????????????????????????TCTTTCATGGGGAAGCAGATTTGGGTACCACCCAAGTATTGACTCACCCATCAACAACCGCCATGTATTTCGTACATTACTGCCAGCCACCATGAATATTGTACGGTACCATAAATACTTGACCACCTGTAGTACATAAAAACCCAAT--CCACATCAAAA-----CCCCCTCCCCATGCTTACAAGCAAGTACAGCAATCAACCTTCAACTATCACACATCAACTGCAACTCCAAAGCCA-CCCCTCACCCACTAGGATATCAACAAACCTACCCATCCTTAACAGTACATGGTACATAAAGCCATTTACCGTACATAGCACATTACAGTCAAATCCCTTCTCGTCCCCATGGATGACCCCC? } [[Structure]] StructureName="New Edited Structure" NbGroups=1 Group={ "Mandenka" } 按照這個格式，文件是可以識別的 |
8樓2011-03-30 17:01:42
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9樓2012-03-19 19:03:58
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