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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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[交流] 【求助】CBS-QB3單點(diǎn)能計(jì)算

B3LYP優(yōu)化完的結(jié)構(gòu)，用CBS-QB3作單點(diǎn)能計(jì)算時(shí)，為什么結(jié)構(gòu)還會(huì)改變？好像這個(gè)過(guò)程中還有優(yōu)化。

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1樓 2011-02-26 15:37:56

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請(qǐng)高人指點(diǎn)啊，必重謝。

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2樓2011-02-27 01:06:46

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zxzbl

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我會(huì)做最好的自己，提高自己，讓自己更加優(yōu)秀。

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3樓2011-02-27 03:10:50

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fooo

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313588908(金幣+2): 謝謝 2011-02-27 16:41:43

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Originally posted by 313588908 at 2011-02-26 15:37:56:
B3LYP優(yōu)化完的結(jié)構(gòu)，用CBS-QB3作單點(diǎn)能計(jì)算時(shí)，為什么結(jié)構(gòu)還會(huì)改變？好像這個(gè)過(guò)程中還有優(yōu)化。

CBS是一個(gè)復(fù)合算法，當(dāng)然里面有優(yōu)化步驟。

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4樓2011-02-27 04:28:16

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那怎么才能只做單點(diǎn)能計(jì)算呢？

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5樓2011-02-27 11:27:36

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我見(jiàn)到過(guò)文章中有人提到‘在CBS-QB3水平上計(jì)算出了各物種的單點(diǎn)能’，不知是怎么算的。是不是需要自己一步步手工算啊？

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6樓2011-02-27 16:44:45

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fooo

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zhou2009(金幣+3): 2011-02-28 08:49:44
313588908(金幣+2): 審稿意見(jiàn)只讓我算個(gè)單點(diǎn)能，若用CBS-QB3，相當(dāng)于又優(yōu)化了一遍。而且體系有20-30個(gè)原子左右的，算不動(dòng)啊 2011-03-02 14:17:38

引用回帖:

Originally posted by 313588908 at 2011-02-27 16:44:45:
我見(jiàn)到過(guò)文章中有人提到‘在CBS-QB3水平上計(jì)算出了各物種的單點(diǎn)能’，不知是怎么算的。是不是需要自己一步步手工算�。�

只要是CBS這樣的復(fù)合算法，結(jié)構(gòu)優(yōu)化是必須的。單點(diǎn)能直接取最后的值就行，至于過(guò)程不必去管。

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7樓2011-02-28 03:33:39

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mscic

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313588908(金幣+1): 具體怎么操作呢？其實(shí)CBS和一般的方法不一樣 2011-03-02 14:15:22

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Originally posted by fooo at 2011-02-28 03:33:39:
只要是CBS這樣的復(fù)合算法，結(jié)構(gòu)優(yōu)化是必須的。單點(diǎn)能直接取最后的值就行，至于過(guò)程不必去管。

先優(yōu)化好，再計(jì)算優(yōu)化好的構(gòu)型的單點(diǎn)。

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8樓2011-02-28 11:39:00

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我的審稿意見(jiàn)中有這句：the authors need to perform single points on ALL of their structures using high-level ab initio molecular orbital theory e.g. G4 calculations or CBS-QB3. 實(shí)在不明白G4 calculations or CBS-QB3能作單點(diǎn)能計(jì)算？怎么辦啊，只給兩周修改。望高人指點(diǎn)啊。

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9樓2011-03-01 21:36:30

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fooo

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313588908(金幣+2): 其實(shí)我早就試過(guò)了，發(fā)現(xiàn)了問(wèn)題才來(lái)問(wèn)的�，F(xiàn)在甚至在懷疑審稿意見(jiàn) 2011-03-02 14:14:21

引用回帖:

Originally posted by 313588908 at 2011-03-01 21:36:30:
我的審稿意見(jiàn)中有這句：the authors need to perform single points on ALL of their structures using high-level ab initio molecular orbital theory e.g. G4 calculations or CBS-QB3. 實(shí)在不明白G4 calculat ...

當(dāng)然能做。你在命令行里直接寫(xiě)G4或CBS就行了，連基組都不用輸入。這個(gè)光問(wèn)不行，你必須親自試一試才能知道這類(lèi)復(fù)合算法是怎么進(jìn)行的。

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10樓2011-03-02 02:16:30

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Originally posted by fooo at 2011-03-02 02:16:30:
當(dāng)然能做。你在命令行里直接寫(xiě)G4或CBS就行了，連基組都不用輸入。這個(gè)光問(wèn)不行，你必須親自試一試才能知道這類(lèi)復(fù)合算法是怎么進(jìn)行的。

顧問(wèn)大人，我是算完了，發(fā)現(xiàn)結(jié)構(gòu)有變化，然后查資料發(fā)現(xiàn)G4或CBS默認(rèn)就是先優(yōu)化。然后計(jì)算量又很大，實(shí)在沒(méi)轍了。對(duì)于這類(lèi)方法老板也不熟悉。頭疼中。。。。

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12樓2011-03-02 13:03:43

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tangbohejin

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313588908(金幣+1): 謝謝 2011-03-02 14:13:05

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Originally posted by mscic at 2011-02-28 11:39:00:
先優(yōu)化好，再計(jì)算優(yōu)化好的構(gòu)型的單點(diǎn)。

支持該觀點(diǎn)。

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13樓2011-03-02 13:20:13

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Originally posted by tangbohejin at 2011-03-02 13:20:13:
支持該觀點(diǎn)。

我先優(yōu)化了（用B3LYP/6-31+G**）,然后想按照審稿意見(jiàn)用CBS-QB3作單點(diǎn)能的，結(jié)果默認(rèn)又優(yōu)化了。真懷疑審稿意見(jiàn)---CBS-QB3不能作單點(diǎn)能。

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14樓2011-03-02 14:12:40

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fooo

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Originally posted by 313588908 at 2011-03-02 14:12:40:
我先優(yōu)化了（用B3LYP/6-31+G**）,然后想按照審稿意見(jiàn)用CBS-QB3作單點(diǎn)能的，結(jié)果默認(rèn)又優(yōu)化了。真懷疑審稿意見(jiàn)---CBS-QB3不能作單點(diǎn)能。

審稿意見(jiàn)應(yīng)該是沒(méi)問(wèn)題的。CBS或G4這些復(fù)合算法肯定是要采用自己的算法和基組重新進(jìn)行優(yōu)化的，還會(huì)給算頻率。所以，沒(méi)什么好辦法，這都是規(guī)定好的，你改動(dòng)不得。不過(guò)，就能量而言，其精度應(yīng)該是相當(dāng)高的，甚至連優(yōu)化的結(jié)構(gòu)也比你的B3LYP/6-31+G**要好。當(dāng)然，缺點(diǎn)就是計(jì)算量大了些。

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16樓2011-03-02 14:26:23

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Originally posted by fooo at 2011-03-02 14:26:23:
審稿意見(jiàn)應(yīng)該是沒(méi)問(wèn)題的。CBS或G4這些復(fù)合算法肯定是要采用自己的算法和基組重新進(jìn)行優(yōu)化的，還會(huì)給算頻率。所以，沒(méi)什么好辦法，這都是規(guī)定好的，你改動(dòng)不得。不過(guò)，就能量而言，其精度應(yīng)該是相當(dāng)高的，甚至連 ...

實(shí)際上CBS-QB3中的計(jì)算優(yōu)化和頻率是在B3LYP/6-311G(2d,d,p) 中進(jìn)行的，只是后面的能量通過(guò)多種高精度算法排除或減少了基組的誤差。計(jì)算時(shí)間的確很長(zhǎng)，我做的又是一個(gè)綜述型的文章。要改的數(shù)據(jù)太多，不想翻工了。就只能算幾個(gè)例子比較一下了。

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17樓2011-03-02 17:34:17

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caoeagle0122

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樓主，想問(wèn)一下，用G4算單點(diǎn)能的時(shí)候最終讀取的是哪個(gè)數(shù)值��？我對(duì)這幾個(gè)結(jié)果已經(jīng)茫然了，期待樓主回答，謝謝啦

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18樓2017-11-26 23:54:31

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mgfudan

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cbs-qb3是熱力學(xué)組合方法，some experts said that：稍微看原文就知道根本不是算單點(diǎn)用的
倘若出于特殊目的，做CBS-QB3的時(shí)候就是想把自動(dòng)做的幾何優(yōu)化和振動(dòng)分析步驟忽略掉，可以用CBS-QB3=SP。從G16開(kāi)始才支持這么用

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19樓2020-02-04 22:13:40

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zyxme11樓

2011-03-02 04:58 回復(fù)

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幸福xxxx15樓

2011-03-02 14:15 回復(fù)

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