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【求助】請問這個構(gòu)型用ATK怎么構(gòu)造呀?
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呵呵 MS有很多輸入格式 其中一個是 ############ 22 C -1.777745515 -2.400590108 -2.995031451 C -1.757468884 -1.087438605 -3.504002591 C -1.649690043 0.002953698 -2.615787114 C -1.607767113 -0.268204570 -1.257439445 C -1.669375032 -1.573928904 -0.728739160 C -1.745734408 -2.651138846 -1.622998580 H -1.833684069 -3.248687132 -3.704887395 H -1.638939582 1.046590774 -2.989774537 H -1.796858327 -3.693361308 -1.247803012 C -1.652668588 -0.258090441 1.245841793 C -1.694163548 0.010718989 2.606694564 C -1.786162715 -1.080856382 3.495827083 C -1.809965641 -2.393708345 2.987639993 C -1.765017898 -2.644774204 1.617138092 C -1.688861051 -1.567769185 0.721920697 H -1.679117401 1.052936628 2.984284427 H -1.866792191 -3.239924161 3.699569958 H -1.792450873 -3.687972721 1.242283709 S -1.356973288 0.995739042 -0.011734104 O -2.404209668 2.057139153 -0.065058455 S -1.875373411 -0.720088841 -5.200077926 S -1.875220754 -0.719734529 5.195343452 ################################## 把上面的數(shù)據(jù)坐標(biāo)放入文本文件中然后另存為 DBT.xyz 那么就可以把這個導(dǎo)入VNL了 1,點擊Result Browser 點擊Open 找到電腦DBT.xyz 文件 確定 那么就變成VNL的格式了 具體能不能幫到你 我就不知道了 |
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電極是先建立好的 然后加入你的分子 1,以金(111)面電極為例 在Crystal Cupboard 中選擇 Au 然后將右下角的 Drag。。。 拖入Atomic Manipulator 右鍵點擊右側(cè)黑色部分 Cleave 在 Surface 和Two-probe終不過設(shè)定 電極切面 電極大小 建立你想要的電極 2,如果你是在MolecularBulider中構(gòu)造的分子 直接點擊右下角圖標(biāo) 拖入 電極的黑色區(qū)域 分子就添加到坐標(biāo)原點(000)然后通過平移選擇將分子移動到電極合適的位置 如果是通過別的方法建立的分子 按照前面的帖子把它轉(zhuǎn)成VNL的格式 復(fù)制于 Script Editor 然后拖入電極黑色區(qū)域 具體操作對照手冊慢慢練習(xí)吧 |
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