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背景和目的 新城疫病毒 (Neweastle diseasevirus,NDV)屬副粘病毒科Avulavirus屬,為單股負鏈RNA病毒,由Doyle于1927年首次分離并命名[1]。NDV能夠在禽類中引起一種致死率極高的急性接觸性傳染病----新城疫,雞、火雞及野雞等都有易感性。NDV在極少數(shù)情況下可以感染人類,表現(xiàn)為輕微的結(jié)膜炎或溫和的呼吸道癥狀[2],目前沒有發(fā)現(xiàn)人到人的水平感染,但近些年來新城疫病毒更多的是以其抗腫瘤作用強、對人安全性高等特點吸引著越來越多的關(guān)注。NDV能感染多種人類腫瘤細胞且不依賴于腫瘤細胞增殖而獨立復(fù)制繁殖,又據(jù)sateesh[2]等報道:腫瘤細胞不能發(fā)揮有效的抗病毒作用是因為干擾素信號轉(zhuǎn)換途徑的損傷,從而使NDV在細胞中生長復(fù)制,進一步殺傷腫瘤細胞。本實驗的研究對象為未知序列的新城疫病毒F株,目的在于通過分子生物學(xué)、細胞學(xué)及信息技術(shù)方面的方法對其F基因序列進行比對分析,也出于對實驗室安全的考慮,分析F基因112~117位點,可以確定其型別及致病性、抗腫瘤細胞選擇性等。 材料和方法 選取本校分離自圈養(yǎng)禽類的F株(2008年分離),接種雞胚以擴增病毒,48h后收取雞胚尿囊液,測定血凝效價≥1:1024后,其血凝性均可被NDV的陽性血清所抑制而不被禽流感(H9和H5)單因子陽性血清及EDS-76陽性血清抑。采用紅細胞吸附釋放法純化病毒,使其血凝效價≥1:1024,常規(guī)復(fù)蘇人傳代食道癌細胞EC109細胞進行細胞學(xué)實驗,復(fù)蘇后選擇生長狀態(tài)良好,密度較大的進行NDV F株感染試驗,觀察其抗腫瘤效果,選擇最好溶瘤效果的病毒液進行分子生物學(xué)研究,用RNA試劑盒提取病毒RNA后,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA。根據(jù)GenBank上所公布的新城疫病毒的全基因組序列和相關(guān)參考文獻[6,7],采用Prime5.0系統(tǒng)設(shè)計3對引物,引物設(shè)計采取使擴增片段之間部分相互重疊的原則,使片段連接起來可以覆蓋整個病毒基因組,特異性片段的PCR產(chǎn)物純化并測序,從而獲得F基因組序列,并通過生物信息學(xué)軟件對其與其他NDV國際毒株進行了比較分析,繪制系統(tǒng)發(fā)育進化樹,確定NDV F株的分子生物學(xué)特征及進化關(guān)系,其關(guān)鍵序列為:112G-K-Q-G-R-L117,符合國際標準弱毒株規(guī)律,判定NDVF株為弱毒株。 結(jié)論: 1. NDV F株是一株具有殺傷腫瘤細胞且具有正常病毒毒力的毒株,溶瘤效果主要在呼吸道和消化道上皮癌細胞效果明顯,符合弱毒株的特性。 2. NDVF株F基因組序列由1708個堿基組成,屬于基因Ⅱ型弱毒力病毒株。 3.NDV株與其他GenBank上公布的24株毒株比較,核苷酸同源性在73%一95.5%之間,氨基酸同源性在50.7%一90.6%之間。 4. NDV F株與基因Ⅱ型國際標準弱毒株clone30株和LaSota株在系統(tǒng)發(fā)生進化樹同一分支上,具有親緣關(guān)系。 |
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木蟲 (正式寫手)
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