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321wangke321金蟲 (正式寫手)
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[交流]
【求助/交流】兼并引物 已有4人參與
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| 我設(shè)計(jì)了兼并引物，是用蛋白序列設(shè)計(jì)的，現(xiàn)在想知道引物在序列上的位置，因?yàn)椴恢罃U(kuò)增片段的長度。如果用比對軟件，如何使用呢？我用過Blast及其它軟件，都得不到結(jié)果，請教下哪位前輩可以給我些指導(dǎo)。謝謝！ |
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yabxxh
木蟲 (正式寫手)
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小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
amisking(金幣+2): 鼓勵發(fā)帖交流。 2011-03-11 20:49:26
小木蟲(金幣+0.5):給個(gè)紅包，謝謝回帖交流
amisking(金幣+2): 鼓勵發(fā)帖交流。 2011-03-11 20:49:26
| 這位同學(xué)，你設(shè)計(jì)兼并引物的目的是什么呢？是想像特異引物那樣從基因組中擴(kuò)增到特定長度的片段嗎？既然是簡并引物，那就說明你只是知道某類基因的保守氨基酸序列，你要用這段氨基酸的序列，擴(kuò)增到你需要的基因。那你為什么還要知道基因的長度呢，你去Blast的話，也只能去Blast那段保守的氨基酸序列吧。不知道你想用什么方法來克隆你的基因，你不會想直接用簡并引物擴(kuò)增出來吧。我覺得你用簡并引物擴(kuò)增的序列測序之后還要進(jìn)行5‘和3’RACE才能得到你的基因，僅供參考，好運(yùn) |
2樓2011-03-11 14:50:46
3樓2011-03-11 15:17:32
321wangke321
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4樓2011-03-11 18:36:52
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5樓2011-03-11 18:37:28
6樓2011-03-11 20:05:33
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7樓2011-03-11 20:27:21
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