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nash603至尊木蟲 (文壇精英)
飄落的碎冰
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[交流]
【交流】如何在堆積圖中圖表示P-P共軛? 已有7人參與
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如何在堆積圖中圖表示P-P共軛? Diamond,mercury,XP那個效果好點呢?都什么表示的? planton計算結(jié)果能說明多少問題呢? 找到具有P-P作用的環(huán),插入亞原子,連接亞原子,然后再設(shè)置剛連接的鍵和亞原子,就OK了!亞原子的插入具體是:Ctrl鍵,選中參與p-p作用的一個環(huán)的所有原子(比如苯環(huán)或其他的芳環(huán))。structure中點選insert atom,確定后就加上了一個亞原子,同法加入其他亞原子,連接p-p作用的亞原子,如果不放心測量一下距離。選中連接而成的新建,右鍵edit------Bond designs tyl----thick radius----0.03 fragmentationg----5 colcor(Fi)---隨便選 確定。點選亞原子(所有的),右鍵--edit---atom design Transparency-----1 diamond畫法 關(guān)于 π-π堆積怎么畫 XP的計算辦法 假設(shè)一個苯環(huán)上碳原子編號分別為C11,C12,C13,C14,C15,C16,另一個苯環(huán)碳原子編號為C21,C22,C23,C24,C25,C26,用shelxtl 97 ,在XP界面執(zhí)行如下操作: cent/x c11 to c16(回車后,會給出中心,比如X1A) cent/x c21 to c26(回車后,會給出中心,比如X1B) join X1A X1B(回車) bang(回車,會給出兩中心的距離) π-π作用有三種作用形式,一是face to face,距離在3.6+- 0.4A 二是offset,一般d 在3.2~3.8Å, z 在4.0~5.5 Å, 三是edge to face,邊面作用的兩環(huán)中心的距離一般在4.5~7.0 Å,而5.0 Å 則為最佳值 關(guān)于π-π共軛作用 繼續(xù)整理中.... |
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