biofeixue

木蟲 (著名寫手)

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[交流] 【求助/交流】內(nèi)標的引物內(nèi)是否允許二聚體?

最近看了一篇影響因子為11的文章,里面的引物是有兩個錯誤,為什么可以這樣?
The TUB2 (for ß-tubulin) gene was used as an internal control in RT-PCR.
Sense： 5’-GTTCTCGATGTTGTTCGTAAG-3’
Anti： 5’-TGTAAGGCTCAACCACAGTAT-3’

[ Last edited by biofeixue on 2011-4-5 at 06:18 ]

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1樓 2011-04-05 06:05:29

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jiangzhiang

鐵桿木蟲 (正式寫手)

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★
1949stone(金幣+1): 似的有些時候的確是藏著不告訴 2011-04-05 11:35:54
biofeixue(金幣+2): 2011-04-06 05:40:11

能擴出來就是好引物

當然不排除是不想告訴讀者

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2樓2011-04-05 09:54:35

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西瓜

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★ ★ ★ ★ ★ ★
1949stone(金幣+6): 高人 2011-04-05 15:55:21
biofeixue(金幣+2): 2011-04-06 05:40:24

引用回帖:

Originally posted by biofeixue at 2011-04-05 06:05:29:
最近看了一篇影響因子為11的文章,里面的引物是有兩個錯誤,為什么可以這樣?
The TUB2 (for ß-tubulin) gene was used as an internal control in RT-PCR.
Sense： 5’-GTTCTCGATGTTGTTCGTAAG-3’
...

如果是用于熒光定量PCR的內(nèi)參，這對引物不合格，呵呵~
不過如果是半定量的話，問題就不大了。
我也曬對文獻上的引物，熒光定量PCR的Actin內(nèi)參，比你的爛多了……

一看這分析結(jié)果，果斷自己設計了一對100分的。

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3樓2011-04-05 12:33:21

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西瓜

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biofeixue(金幣+2): 2011-04-06 05:39:30

引用回帖:

話說編輯和審稿人也不可能一一去check引物的啦。做出來的結(jié)果說得通就行。

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4樓2011-04-05 12:34:52

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dreaming0816

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biofeixue(金幣+2): 2011-04-06 05:39:23

只要二聚體和目的片段沒在一起，跑電泳能分別開就可以啦

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5樓2011-04-05 12:36:29

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西瓜

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biofeixue(金幣+2): 2011-04-06 05:39:16

引用回帖:

Originally posted by dreaming0816 at 2011-04-05 12:36:29:
只要二聚體和目的片段沒在一起，跑電泳能分別開就可以啦

如果用于熒光定量PCR，二聚體、錯配產(chǎn)物這些都能產(chǎn)生熒光信號，會干擾定量結(jié)果滴。

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6樓2011-04-05 12:43:22

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yj-lzx

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1949stone(金幣+2): 鼓勵 2011-04-05 15:55:44
biofeixue(金幣+2): 2011-04-06 05:39:10

只要能擴出目的片段，即使有二聚體也無所謂啊~~~
而且這篇文章的引物二聚體<50bp，很明顯可以跟目的片段區(qū)分開來~~~

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7樓2011-04-05 13:55:51

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jhu132llh

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amisking(金幣+1, EPI+1): 鼓勵發(fā)帖交流。 2011-04-05 19:24:41
biofeixue(金幣+2): 2011-04-06 05:38:58

引用回帖:

話說這種結(jié)果還是很多的
只要能P出來
人家是不管這個的。
大牛雜志的編輯都是大牛，誰有心情給去驗證引物

這個還是好的
好多的文章敘述方法的時候通常都是語出不詳，模模糊糊的
已到關鍵地方他就不說了
你也拿他沒辦法

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8樓2011-04-05 17:16:49

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