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lixiaocat

銀蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 7 (幼兒園)
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蟲號: 1248445

[交流] 【求助】TS過渡態(tài)總是L301錯誤，我要哭了~~~

要做一個羥基自由基奪取2,4,5三氯酚上羥基氫的過渡態(tài)
這是我的輸入文件
%chk=ts1-2
%mem=150MW
%nproc=8
#p opt=(calcfc,ts,noeigentest,maxcycl=200) freq mp2/6-311+g(d,p)
scrf=(solvent=water) guess=read geom=connectivity optcyc=200
iop(1/11=1,2/16=1,5/13=1)

ts1-2

0 2
C
C                1             B1
C                2             B2 1             A1
C                3             B3 2             A2 1             D1
C                4             B4 3             A3 2             D2
C                5             B5 4             A4 3             D3
H                2             B6 1             A5 6             D4
H                5             B7 4             A6 3             D5
O                4             B8 3             A7 2             D6
H                9             B9 4             A8 3             D7
Cl                3          B10 2             A9 1             D8
Cl                1          B11 2          A10 3             D9
Cl                6          B12 5          A11 4          D10
O                9          B13 4          A12 3          D11
H                14          B14 9          A13 4          D12

B1          1.38960122
B2          1.38958796
B3          1.40463410
B4          1.39862108
B5          1.38770592
B6          1.08147126
B7          1.08178453
B8          1.34262550
B9          1.05400000
B10          1.72823000
B11          1.74570346
B12          1.74434560
B13          2.35239415
B14          0.97370785
A1          120.15822454
A2          121.54171910
A3          117.47551141
A4          121.38215925
A5          119.79335544
A6          118.22078710
A7          124.82662770
A8          128.00000000
A9          118.66745836
A10       118.87027986
A11       118.52464701
A12       121.31114852
A13       100.52534923
D1          1.57361244
D2          -1.60846309
D3          0.48428673
D4       -179.22255337
D5       -179.93166928
D6          178.77857492
D7          -18.95612259
D8       -176.86511936
D9          179.38358497
D10       -179.87723870
D11       -31.42153557
D12       -52.47926078

1 2 1.5 6 1.5 12 1.0
2 3 1.5 7 1.0
3 4 1.5 11 1.0
4 5 1.5 9 1.5
5 6 1.5 8 1.0
6 13 1.0
7
8
9 10 1.0
10 14 1.0
11
12
13
14 15 1.0
15

報錯是
United Atom Topological Model (UA0  parameters set).
UA0: Hydrogen 10 has 2 bonds. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.
Error termination via Lnk1e in /public/soft/Gauss03/g03/l301.exe at Thu Apr 14 10:33:26 2011.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  8.2 seconds.

坐等救命

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1樓 2011-04-14 10:53:03

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書萬里

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 70 (初中生)
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蟲號: 1244505

★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與

引用回帖:

Originally posted by lixiaocat at 2011-04-14 10:53:03:
要做一個羥基自由基奪取2,4,5三氯酚上羥基氫的過渡態(tài)
這是我的輸入文件
%chk=ts1-2
%mem=150MW
%nproc=8
#p opt=(calcfc,ts,noeigentest,maxcycl=200) freq mp2/6-311+g(d,p)
scrf=(solvent=water) guess= ...

為什么不用用qts3或qts2啊

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2樓2011-04-14 12:44:21

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fatpig8832

鐵桿木蟲 (著名寫手)

★ ★ ★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與
375642546(金幣+2): 2011-04-14 16:27:37

樓主你...

Hydrogen 10 has 2 bonds.

這么大的字你莫非沒看到...

簡單一點，把 geom=connectivity 刪去

再把
1 2 1.5 6 1.5 12 1.0
2 3 1.5 7 1.0
3 4 1.5 11 1.0
4 5 1.5 9 1.5
5 6 1.5 8 1.0
6 13 1.0
7
8
9 10 1.0
10 14 1.0
11
12
13
14 15 1.0
15

全部刪去

再試試...

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3樓2011-04-14 16:22:59

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tangbohejin

木蟲之王 (文學(xué)泰斗)

應(yīng)助: 78 (初中生)
金幣: 124581
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蟲號: 280555

★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與

用qts2--

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4樓2011-04-14 19:26:09

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jjww0001

金蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 7 (幼兒園)
金幣: 709.3
帖子: 243
在線: 152.4小時
蟲號: 101051

★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與

不要用gv直接創(chuàng)建輸入文件，那是垃圾，沒有用的。

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5樓2011-04-14 19:52:38

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曼聯(lián)無敵

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
金幣: 3758.3
帖子: 1161
在線: 98.8小時
蟲號: 822344

★ ★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與
375642546(金幣+1): 2011-04-15 08:51:45

L301是生成基組信息的步驟，應(yīng)該是命令行的問題，報錯也說了H10有兩個鍵，顯然不對，建議樓主再檢查一下體系的結(jié)構(gòu)。

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6樓2011-04-15 08:16:49

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jin912

木蟲 (著名寫手)

應(yīng)助: 5 (幼兒園)
金幣: 4254.5
帖子: 1017
在線: 288.4小時
蟲號: 873534

★ ★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與
375642546(金幣+1): 2011-04-15 08:51:29

Hydrogen 10 has 2 bonds
你的初始結(jié)構(gòu)都不正確
還有就是建議用qst2，你用ts，而且還有溶劑化~~~

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7樓2011-04-15 08:46:29

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zhongrl898

木蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
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在線: 158.1小時
蟲號: 895952

★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與

構(gòu)型猜測不正確，建議使用QST2

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8樓2011-04-15 09:13:53

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ice625

銅蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 174.3
帖子: 305
在線: 68.5小時
蟲號: 804567

★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與

把
1 2 1.5 6 1.5 12 1.0
2 3 1.5 7 1.0
3 4 1.5 11 1.0
4 5 1.5 9 1.5
5 6 1.5 8 1.0
6 13 1.0
7
8
9 10 1.0
10 14 1.0
11
12
13
14 15 1.0
15
刪去，建議做好用CHEMCRAFT軟件畫圖，直接拷坐標(biāo)替換固定的程序文件就行了
記得坐標(biāo)下面還要空上幾行

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9樓2011-04-28 00:31:32

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tangbaowei

木蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 2 (幼兒園)
金幣: 1587.1
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在線: 225.4小時
蟲號: 855348

★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與

估計建模有問題

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10樓2011-05-03 20:33:21

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mscic

金蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 6 (幼兒園)
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蟲號: 443152

★
lixiaocat(金幣+1):謝謝參與

應(yīng)該不是結(jié)構(gòu)的問題，而是溶劑化模型的問題，G03中的PCM默認(rèn)的radii是UA0，而G09中PCM的radii默認(rèn)是UFF，這兩種radii在處理H的時候有一些區(qū)別……

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11樓2011-10-12 11:04:47

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ZDBWHZ

金蟲 (正式寫手)

應(yīng)助: 7 (幼兒園)
金幣: 1882
帖子: 736
在線: 228.7小時
蟲號: 655151

★
小木蟲(金幣+0.5):給個紅包，謝謝回帖

scrf=(cpcm,solvent=water,read)
......

radii=uff

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12樓2011-10-13 18:33:38

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zszjn

銀蟲 (正式寫手)

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金幣: 487
帖子: 366
在線: 194.2小時
蟲號: 2696273

★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖

要做一個結(jié)構(gòu)優(yōu)化（考慮溶劑效應(yīng)）
這是輸入文件：
# B3LYP/6-31G** geom=connectivity OPT SCRF=(PCM,READ,Solvent=water) test SCF=Tight

A44

0 1
C
C                1             B1
C                2             B2 1             A1
C                3             B3 2             A2 1             D1
N                1             B4 2             A3 3             D2
H                2             B5 1             A4 5             D3
H                3             B6 2             A5 1             D4
H                4             B7 3             A6 2             D5
C                1             B8 5             A7 4             D6
C                9             B9 1             A8 5             D7
C                5          B10 1             A9 2             D8
H                11          B11 5          A10 1             D9
H                11          B12 5          A11 1          D10
H                11          B13 5          A12 1          D11
C                9          B14 1          A13 5          D12
H                15          B15 9          A14 1          D13
C                9          B16 1          A15 5          D14
N                17          B17 9          A16 1          D15
O                18          B18 17          A17 9          D16
O                10          B19 9          A18 1          D17
C                17          B20 9          A19 1          D18
H                21          B21 17          A20 9          D19
H                21          B22 17          A21 9          D20
H                21          B23 17          A22 9          D21

B1          1.40175000
B2          1.40124782
B3          1.40184834
B4          1.39179783
B5          1.08481903
B6          1.08481145
B7          1.08923173
B8          2.10384340
B9          1.20662307
B10          1.47000000
B11          1.07000000
B12          1.07000000
B13          1.07000000
B14          1.36170000
B15          1.07000000
B16          1.38029460
B17          1.28500000
B18          1.32587874
B19          1.43000000
B20          1.49230000
B21          1.07000000
B22          1.07000000
B23          1.07000000
A1          109.07834178
A2          106.74085740
A3          106.50573988
A4          126.44075323
A5          126.81725494
A6          130.11211410
A7          155.50317747
A8          109.11082165
A9          125.59658900
A10       109.47120255
A11       109.47120255
A12       109.47123134
A13          41.24974249
A14       121.82032679
A15       152.23676038
A16       111.83860613
A17       100.64448547
A18       124.55736225
A19       133.72548892
A20       109.47120255
A21       109.47120255
A22       109.47123134
D1          -0.00472875
D2          0.00000000
D3          180.00000000
D4       -180.00000000
D5       -179.99201401
D6          147.76327266
D7       -150.12552641
D8          179.98442604
D9          150.38072621
D10       -89.61925899
D11          30.38073361
D12          45.68019108
D13       179.07632216
D14          35.11549995
D15       156.44810647
D16          16.38370461
D17          10.26511811
D18          -8.15428910
D19       -48.61759650
D20          71.38241829
D21       -168.61758910

1 2 2.0 5 1.0 15 1.0
2 3 1.0 6 1.0
3 4 2.0 7 1.0
4 5 1.0 8 1.0
5 11 1.0
6
7
8
9 10 1.0 15 2.0 17 1.0
10 19 1.0 20 2.0
11 12 1.0 13 1.0 14 1.0
12
13
14
15 16 1.0
16
17 18 2.0 21 1.0
18 19 1.0
19
20
21 22 1.0 23 1.0 24 1.0
22
23
24

ALPHA=1.21
TSARE=0.4
報錯信息：
United Atom Topological Model (UA0  parameters set).
UA0: Hydrogen 6 has 2 bounds. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.
Error termination via Lnk1e in d:\gauss\l301.exe at Tue May 06 09:50:02 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  2.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    12 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1
聲明一下，在不考慮溶劑的情況下沒有錯誤。

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回復(fù)此樓

13樓2014-05-06 10:00:31

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